98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1470 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1470  protein of unknown function DUF833  100 
 
 		 271 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0397619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1429  protein of unknown function DUF833  99.26 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235139  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1780  putative signal peptide protein  92.25 
 
 		 272 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000400894  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1430  hypothetical protein  66.67 
 
 		 275 aa  339  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.09598  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1832  hypothetical protein  62.68 
 
 		 284 aa  327  9e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869889  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0969  hypothetical protein  51.6 
 
 		 285 aa  285  8e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0589  hypothetical protein  45.42 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1205  protein of unknown function DUF833  46.9 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0792  hypothetical protein  48.4 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2245  hypothetical protein  43.55 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2151  hypothetical protein  47.13 
 
 		 283 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2284  hypothetical protein  45.98 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0642523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3385  hypothetical protein  45.98 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2323  hypothetical protein  45.98 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1192  hypothetical protein  45.98 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539326  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1919  hypothetical protein  45.98 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2446  hypothetical protein  45.98 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5376  hypothetical protein  47.1 
 
 		 248 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0231  hypothetical protein  45.85 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1255  hypothetical protein  44.19 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5051  hypothetical protein  45.59 
 
 		 248 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4216  hypothetical protein  45.35 
 
 		 248 aa  195  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5144  hypothetical protein  45.59 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142216  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48200  hypothetical protein  48.85 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4017  hypothetical protein  41.92 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.312319  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2200  hypothetical protein  45.28 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0734  protein of unknown function DUF833  44.11 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000353958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0321  hypothetical protein  45.74 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.839097  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5197  hypothetical protein  45.98 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2506  protein of unknown function DUF833  48.45 
 
 		 266 aa  192  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.367832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0432  hypothetical protein  47.49 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1040  hypothetical protein  50.41 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0721  protein of unknown function DUF833  44.88 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144425  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1936  protein of unknown function DUF833  46.48 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751101  normal  0.504392 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0026  hypothetical protein  46.15 
 
 		 254 aa  188  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1919  hypothetical protein  47.18 
 
 		 281 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.303193 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1896  hypothetical protein  47.18 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6183  hypothetical protein  47.18 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01011  hypothetical protein  39.92 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0890099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1805  hypothetical protein  46.37 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0126825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1833  hypothetical protein  45.97 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2266  putative signal peptide protein  45.97 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04430  hypothetical protein  46.33 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1378  hypothetical protein  45.97 
 
 		 281 aa  175  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0121  hypothetical protein  36.92 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5196  hypothetical protein  45.56 
 
 		 281 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0126  hypothetical protein  36.54 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4233  hypothetical protein  36.54 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0125  protein of unknown function DUF833  36.54 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3748  hypothetical protein  35.97 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000326154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4154  hypothetical protein  35.69 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0122  hypothetical protein  33.83 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0645812  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4830  hypothetical protein  34.62 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1864  hypothetical protein  39.42 
 
 		 318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1867  hypothetical protein  33.99 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2166  protein of unknown function DUF833  41.13 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1696  protein of unknown function DUF833  41.83 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4674  hypothetical protein  42.31 
 
 		 248 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0226025  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1330  hypothetical protein  42.69 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4437  hypothetical protein  35.18 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3629  hypothetical protein  35.77 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0090  hypothetical protein  35.61 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1874  hypothetical protein  40.54 
 
 		 319 aa  155  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0593  protein of unknown function DUF833  40.48 
 
 		 250 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0116  hypothetical protein  34.52 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.20644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0126  hypothetical protein  34.13 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0121  hypothetical protein  34.52 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0375691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0121  hypothetical protein  34.52 
 
 		 266 aa  152  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2435  hypothetical protein  40.38 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0043  hypothetical protein  31.18 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0880  protein of unknown function DUF833  48.5 
 
 		 179 aa  146  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2522  hypothetical protein  40.5 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0545504  hitchhiker  0.00352676 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04376  hypothetical protein  41.15 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.982217  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2575  hypothetical protein  39.92 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2311  hypothetical protein  31.48 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2329  hypothetical protein  32.82 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465577 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2009  hypothetical protein  31.07 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0266  hypothetical protein  30.94 
 
 		 232 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00340  conserved hypothetical protein  26.91 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3553  protein of unknown function DUF833  35.94 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26585  predicted protein  29.83 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3735  protein of unknown function DUF833  28.81 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.451552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3677  hypothetical protein  30.04 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3818  protein of unknown function DUF833  28.81 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3804  hypothetical protein  31.15 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4738  protein of unknown function DUF833  28 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0713  hypothetical protein  37.86 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3020  hypothetical protein  40 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.401394  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0796  protein of unknown function DUF833  33.85 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57105  predicted protein  38.16 
 
 		 339 aa  57  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.669873 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1772  protein of unknown function DUF833  31.71 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06058  DUF833 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09530)  30.38 
 
 		 311 aa  53.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.695721 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2318  protein of unknown function DUF833  32.24 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.371027 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0180  protein of unknown function DUF833  31.88 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425571  normal  0.150181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4630  protein of unknown function DUF833  31.72 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.057436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1933  hypothetical protein  30.97 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112632  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1537  protein of unknown function DUF833  29.36 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1833  hypothetical protein  29.61 
 
 		 273 aa  42  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>