101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4216 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4216  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  494  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5376  hypothetical protein  60.98 
 
 		 248 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0432  hypothetical protein  65.45 
 
 		 251 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48200  hypothetical protein  65.57 
 
 		 250 aa  296  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5051  hypothetical protein  61.48 
 
 		 248 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5197  hypothetical protein  61.07 
 
 		 248 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5144  hypothetical protein  61.48 
 
 		 248 aa  294  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142216  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0321  hypothetical protein  60.25 
 
 		 248 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.839097  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04430  hypothetical protein  63.41 
 
 		 251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2200  hypothetical protein  49.59 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0721  protein of unknown function DUF833  49 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0734  protein of unknown function DUF833  48.59 
 
 		 258 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000353958 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1205  protein of unknown function DUF833  50 
 
 		 256 aa  210  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0589  hypothetical protein  45.15 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0231  hypothetical protein  49.38 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1430  hypothetical protein  48.85 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.09598  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0792  hypothetical protein  48.74 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1832  hypothetical protein  46.1 
 
 		 284 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869889  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0026  hypothetical protein  46.12 
 
 		 254 aa  197  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0593  protein of unknown function DUF833  45.38 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2245  hypothetical protein  41.77 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1255  hypothetical protein  49.21 
 
 		 258 aa  189  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1470  protein of unknown function DUF833  45.35 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0397619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1429  protein of unknown function DUF833  45.35 
 
 		 271 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235139  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1780  putative signal peptide protein  45.74 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000400894  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4017  hypothetical protein  41.7 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.312319  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2435  hypothetical protein  43.43 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01011  hypothetical protein  40.16 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0890099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1919  hypothetical protein  46.64 
 
 		 281 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.303193 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6183  hypothetical protein  46.64 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1896  hypothetical protein  46.64 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4830  hypothetical protein  41.37 
 
 		 252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2266  putative signal peptide protein  47.33 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1378  hypothetical protein  47.04 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1936  protein of unknown function DUF833  47.29 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751101  normal  0.504392 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0969  hypothetical protein  38.87 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1867  hypothetical protein  37.55 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1330  hypothetical protein  45.45 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480841  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5196  hypothetical protein  47.66 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2446  hypothetical protein  46.12 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1919  hypothetical protein  46.12 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3385  hypothetical protein  46.12 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2284  hypothetical protein  46.12 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0642523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2323  hypothetical protein  46.12 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1192  hypothetical protein  46.12 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539326  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2151  hypothetical protein  46.67 
 
 		 283 aa  175  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358972  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1833  hypothetical protein  45.96 
 
 		 281 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1805  hypothetical protein  45.96 
 
 		 281 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0126825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1040  hypothetical protein  47.26 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0126  hypothetical protein  39.92 
 
 		 267 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0121  hypothetical protein  39.92 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4233  hypothetical protein  39.92 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2506  protein of unknown function DUF833  45.24 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.367832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0125  protein of unknown function DUF833  39.92 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0122  hypothetical protein  39.76 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0645812  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4437  hypothetical protein  37.4 
 
 		 253 aa  168  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0090  hypothetical protein  40.16 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0043  hypothetical protein  37.14 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0126  hypothetical protein  39.6 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0121  hypothetical protein  40.4 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0116  hypothetical protein  40.4 
 
 		 266 aa  164  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.20644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0121  hypothetical protein  40.4 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0375691 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3629  hypothetical protein  39.43 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2166  protein of unknown function DUF833  42.74 
 
 		 256 aa  158  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3748  hypothetical protein  38.89 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000326154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1696  protein of unknown function DUF833  40 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187998 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2311  hypothetical protein  37.5 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4154  hypothetical protein  38 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2575  hypothetical protein  44.4 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4674  hypothetical protein  43.95 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0226025  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2522  hypothetical protein  40.25 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0545504  hitchhiker  0.00352676 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2329  hypothetical protein  37.5 
 
 		 278 aa  143  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1864  hypothetical protein  38.74 
 
 		 318 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1874  hypothetical protein  39.08 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2009  hypothetical protein  34.93 
 
 		 294 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04376  hypothetical protein  38.06 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.982217  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0266  hypothetical protein  37.15 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0880  protein of unknown function DUF833  34.68 
 
 		 179 aa  92.4  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0713  hypothetical protein  34.48 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3804  hypothetical protein  35.74 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3818  protein of unknown function DUF833  35.22 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3735  protein of unknown function DUF833  34.78 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.451552  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1933  hypothetical protein  41.72 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112632  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3677  hypothetical protein  33.91 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0180  protein of unknown function DUF833  40.31 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425571  normal  0.150181 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2318  protein of unknown function DUF833  32.48 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.371027 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26585  predicted protein  33 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1833  hypothetical protein  36.57 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3553  protein of unknown function DUF833  36.22 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4738  protein of unknown function DUF833  35.67 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00340  conserved hypothetical protein  34.13 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3020  hypothetical protein  32.07 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.401394  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1772  protein of unknown function DUF833  34.13 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5931  hypothetical protein  40.79 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.0182438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4630  protein of unknown function DUF833  36.24 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.057436 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0796  protein of unknown function DUF833  40.48 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1537  protein of unknown function DUF833  41.86 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57105  predicted protein  30.6 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.669873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2286  protein of unknown function DUF833  37.18 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000585883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1704  hypothetical protein  32.35 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>