91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2286 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2286  protein of unknown function DUF833  100 
 
 
262 aa  511  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000585883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4630  protein of unknown function DUF833  52.53 
 
 
253 aa  242  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.057436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5931  hypothetical protein  50.58 
 
 
238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.0182438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1933  hypothetical protein  46.12 
 
 
246 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112632  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1833  hypothetical protein  41.03 
 
 
273 aa  161  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1537  protein of unknown function DUF833  40.45 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0713  hypothetical protein  37.86 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3020  hypothetical protein  32.58 
 
 
239 aa  99.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.401394  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0180  protein of unknown function DUF833  44.16 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425571  normal  0.150181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4738  protein of unknown function DUF833  31.82 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0266  hypothetical protein  37.5 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0116  hypothetical protein  31.43 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.20644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0121  hypothetical protein  31.15 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0121  hypothetical protein  30.86 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0375691 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2575  hypothetical protein  40 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4216  hypothetical protein  37.82 
 
 
248 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5197  hypothetical protein  37.25 
 
 
248 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5051  hypothetical protein  37.25 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3629  hypothetical protein  33.12 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0321  hypothetical protein  36.6 
 
 
248 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.839097  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0126  hypothetical protein  29.31 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3748  hypothetical protein  31.52 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000326154 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4233  hypothetical protein  31.74 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5144  hypothetical protein  37.25 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142216  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0122  hypothetical protein  31.43 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0645812  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4674  hypothetical protein  34.25 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0226025  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0125  protein of unknown function DUF833  30.46 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0126  hypothetical protein  31.14 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4154  hypothetical protein  31.74 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48200  hypothetical protein  35.29 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0090  hypothetical protein  31.1 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1704  hypothetical protein  36.76 
 
 
225 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0121  hypothetical protein  31.14 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04430  hypothetical protein  36.13 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2311  hypothetical protein  31.61 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0043  hypothetical protein  29.07 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1867  hypothetical protein  28.48 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2329  hypothetical protein  31.9 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.465577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1864  hypothetical protein  36.08 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0989733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4437  hypothetical protein  29.75 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120022  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4830  hypothetical protein  26.98 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0792  hypothetical protein  35 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2318  protein of unknown function DUF833  33.51 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.371027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0432  hypothetical protein  37.11 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4017  hypothetical protein  25.87 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.312319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1330  hypothetical protein  34.64 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480841  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2166  protein of unknown function DUF833  29.73 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5376  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2522  hypothetical protein  34.38 
 
 
295 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0545504  hitchhiker  0.00352676 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12188  hypothetical protein  30.67 
 
 
240 aa  59.7  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910212  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2200  hypothetical protein  31.79 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2245  hypothetical protein  27.53 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0593  protein of unknown function DUF833  34.06 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3818  protein of unknown function DUF833  33.33 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3735  protein of unknown function DUF833  33.94 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.451552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3677  hypothetical protein  33.53 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0231  hypothetical protein  31.55 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1696  protein of unknown function DUF833  33.33 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000187998 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1205  protein of unknown function DUF833  35.54 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0026  hypothetical protein  32.26 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2435  hypothetical protein  33.54 
 
 
272 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01011  hypothetical protein  34.48 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0890099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0589  hypothetical protein  26.14 
 
 
263 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2009  hypothetical protein  27.75 
 
 
294 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3804  hypothetical protein  32.34 
 
 
252 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04376  hypothetical protein  31.87 
 
 
255 aa  52.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.982217  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1874  hypothetical protein  30.11 
 
 
319 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2506  protein of unknown function DUF833  40.23 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.367832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0721  protein of unknown function DUF833  28.99 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0734  protein of unknown function DUF833  31.61 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000353958 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1772  protein of unknown function DUF833  29.32 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1040  hypothetical protein  33.15 
 
 
273 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1255  hypothetical protein  38.46 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129469  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3553  protein of unknown function DUF833  28.96 
 
 
300 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6183  hypothetical protein  39.18 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1919  hypothetical protein  39.18 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.303193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5196  hypothetical protein  33.6 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1896  hypothetical protein  39.18 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1805  hypothetical protein  38.14 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0126825  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1833  hypothetical protein  38.14 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1832  hypothetical protein  27.88 
 
 
284 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869889  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2151  hypothetical protein  33.59 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358972  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2446  hypothetical protein  40 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1378  hypothetical protein  38.14 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1192  hypothetical protein  40 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539326  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2323  hypothetical protein  40 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2284  hypothetical protein  40 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0642523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3385  hypothetical protein  40 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1919  hypothetical protein  40 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1936  protein of unknown function DUF833  39.33 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751101  normal  0.504392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2266  putative signal peptide protein  39.33 
 
 
281 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.166947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>