62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12188 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12188  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  503  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2497  hypothetical protein  36.44 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102141  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0414  hypothetical protein  26.05 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1772  protein of unknown function DUF833  33.57 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0592  hypothetical protein  25.54 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0472951  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3553  protein of unknown function DUF833  31.39 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1501  hypothetical protein  25.65 
 
 
261 aa  62.4  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000155675 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0796  protein of unknown function DUF833  32.58 
 
 
277 aa  62  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985351  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3010  hypothetical protein  25.54 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2318  protein of unknown function DUF833  30.66 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.371027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0231  hypothetical protein  33.08 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1195  hypothetical protein  22.51 
 
 
263 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0713  hypothetical protein  26.34 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5196  hypothetical protein  31.97 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0122  hypothetical protein  29.69 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0645812  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3804  hypothetical protein  27.81 
 
 
252 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2506  protein of unknown function DUF833  26.62 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.367832  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3677  hypothetical protein  26.44 
 
 
249 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1040  hypothetical protein  26.14 
 
 
273 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4674  hypothetical protein  34.17 
 
 
248 aa  52.4  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0226025  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1919  hypothetical protein  31.29 
 
 
281 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.303193 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1805  hypothetical protein  28.31 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0126825  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1378  hypothetical protein  30.61 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1864  hypothetical protein  30 
 
 
318 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0989733 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1896  hypothetical protein  31.29 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1833  hypothetical protein  28.31 
 
 
281 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6183  hypothetical protein  31.29 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1205  protein of unknown function DUF833  31.45 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2286  protein of unknown function DUF833  26.45 
 
 
262 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000585883  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4017  hypothetical protein  29.03 
 
 
255 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.312319  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4154  hypothetical protein  29.03 
 
 
258 aa  49.3  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5931  hypothetical protein  29.73 
 
 
238 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.0182438 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0734  protein of unknown function DUF833  31.3 
 
 
258 aa  48.9  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000353958 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3818  protein of unknown function DUF833  24.71 
 
 
249 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4738  protein of unknown function DUF833  26.92 
 
 
277 aa  48.5  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4233  hypothetical protein  29.46 
 
 
267 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1874  hypothetical protein  26.88 
 
 
319 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3735  protein of unknown function DUF833  24.71 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.451552  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0121  hypothetical protein  28.91 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0125  protein of unknown function DUF833  29.46 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0792  hypothetical protein  27.94 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0126  hypothetical protein  28.68 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3629  hypothetical protein  28.35 
 
 
253 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0090  hypothetical protein  27.97 
 
 
258 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0121  hypothetical protein  25.78 
 
 
266 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0375691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1936  protein of unknown function DUF833  24.88 
 
 
285 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751101  normal  0.504392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3748  hypothetical protein  31.2 
 
 
268 aa  45.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000326154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0043  hypothetical protein  29.51 
 
 
249 aa  45.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0116  hypothetical protein  25 
 
 
266 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.20644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4630  protein of unknown function DUF833  26.28 
 
 
253 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.057436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0721  protein of unknown function DUF833  30.85 
 
 
258 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144425  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1933  hypothetical protein  25.68 
 
 
246 aa  45.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112632  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0121  hypothetical protein  25.78 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2522  hypothetical protein  28.57 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0545504  hitchhiker  0.00352676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4216  hypothetical protein  34.04 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1537  protein of unknown function DUF833  25.29 
 
 
270 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2266  putative signal peptide protein  26.01 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0126  hypothetical protein  25.78 
 
 
266 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1867  hypothetical protein  28.87 
 
 
254 aa  42.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57105  predicted protein  38.27 
 
 
339 aa  42.4  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.669873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1330  hypothetical protein  36.23 
 
 
266 aa  42  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480841  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2311  hypothetical protein  26.12 
 
 
274 aa  41.6  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.986633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>