15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1195 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1195  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  554  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3010  hypothetical protein  41.53 
 
 		 235 aa  192  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0414  hypothetical protein  36.32 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1501  hypothetical protein  34.19 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000155675 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0592  hypothetical protein  32.19 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0472951  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2318  protein of unknown function DUF833  28.29 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.371027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2497  hypothetical protein  27.57 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102141  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4738  protein of unknown function DUF833  31.21 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12188  hypothetical protein  22.51 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910212  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3553  protein of unknown function DUF833  32.77 
 
 		 300 aa  53.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1772  protein of unknown function DUF833  34.78 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0713  hypothetical protein  26.72 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0796  protein of unknown function DUF833  27.27 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1330  hypothetical protein  30.89 
 
 		 266 aa  42  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480841  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3804  hypothetical protein  34.41 
 
 		 252 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>