88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4630 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4630  protein of unknown function DUF833  100 
 
 
253 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.057436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2286  protein of unknown function DUF833  52.53 
 
 
262 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000585883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5931  hypothetical protein  49.01 
 
 
238 aa  195  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.0182438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1933  hypothetical protein  48 
 
 
246 aa  191  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112632  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1833  hypothetical protein  40.86 
 
 
273 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1537  protein of unknown function DUF833  38.55 
 
 
270 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0713  hypothetical protein  36.19 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0180  protein of unknown function DUF833  33.46 
 
 
247 aa  106  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425571  normal  0.150181 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3748  hypothetical protein  32.92 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000326154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3020  hypothetical protein  31.85 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.401394  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3629  hypothetical protein  28.08 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1867  hypothetical protein  24.31 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4154  hypothetical protein  25.97 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0090  hypothetical protein  30.86 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0126  hypothetical protein  29.52 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0122  hypothetical protein  28.92 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0645812  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4674  hypothetical protein  41.04 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0226025  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4830  hypothetical protein  29.7 
 
 
252 aa  72  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4233  hypothetical protein  28.92 
 
 
267 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0125  protein of unknown function DUF833  28.92 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4738  protein of unknown function DUF833  30.77 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4216  hypothetical protein  36.24 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0121  hypothetical protein  28.31 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0121  hypothetical protein  26.38 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0375691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0116  hypothetical protein  26.99 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.20644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0121  hypothetical protein  26.99 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4437  hypothetical protein  27.95 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120022  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1704  hypothetical protein  36.55 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48200  hypothetical protein  35.42 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0231  hypothetical protein  33.8 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2245  hypothetical protein  30.52 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2200  hypothetical protein  35.25 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0043  hypothetical protein  25.79 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2166  protein of unknown function DUF833  34.84 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0126  hypothetical protein  25.77 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5376  hypothetical protein  30.99 
 
 
248 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0266  hypothetical protein  30.61 
 
 
232 aa  62  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2318  protein of unknown function DUF833  34.86 
 
 
244 aa  62.4  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.371027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2522  hypothetical protein  32.68 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0545504  hitchhiker  0.00352676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0792  hypothetical protein  32.52 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01011  hypothetical protein  40 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0890099  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3818  protein of unknown function DUF833  34.84 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1205  protein of unknown function DUF833  40.57 
 
 
256 aa  58.9  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3735  protein of unknown function DUF833  34.84 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.451552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3677  hypothetical protein  35.48 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0589  hypothetical protein  25.32 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2435  hypothetical protein  39.13 
 
 
272 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1255  hypothetical protein  33.54 
 
 
258 aa  55.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129469  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0321  hypothetical protein  33.89 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.839097  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1780  putative signal peptide protein  32.41 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000400894  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1832  hypothetical protein  28.76 
 
 
284 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869889  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5051  hypothetical protein  32.43 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4017  hypothetical protein  26.35 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.312319  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04376  hypothetical protein  30.46 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.982217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0734  protein of unknown function DUF833  30.38 
 
 
258 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000353958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5144  hypothetical protein  33.11 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142216  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2311  hypothetical protein  30.77 
 
 
274 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1430  hypothetical protein  30.46 
 
 
275 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.09598  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0593  protein of unknown function DUF833  34.78 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3804  hypothetical protein  31.85 
 
 
252 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0721  protein of unknown function DUF833  29.75 
 
 
258 aa  52  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144425  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1874  hypothetical protein  33.63 
 
 
319 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1429  protein of unknown function DUF833  31.72 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235139  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1470  protein of unknown function DUF833  31.72 
 
 
271 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0397619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1864  hypothetical protein  40.91 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0989733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5197  hypothetical protein  30.56 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0432  hypothetical protein  40.96 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1330  hypothetical protein  30.14 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04430  hypothetical protein  39.08 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2575  hypothetical protein  33.73 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1696  protein of unknown function DUF833  31.97 
 
 
267 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000187998 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2329  hypothetical protein  29.03 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.465577 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2506  protein of unknown function DUF833  41.33 
 
 
266 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.367832  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3553  protein of unknown function DUF833  32.79 
 
 
300 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2151  hypothetical protein  34.23 
 
 
283 aa  45.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358972  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12188  hypothetical protein  26.28 
 
 
240 aa  45.4  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910212  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1919  hypothetical protein  34.23 
 
 
283 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3385  hypothetical protein  34.23 
 
 
283 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2284  hypothetical protein  34.23 
 
 
283 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0642523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2323  hypothetical protein  34.23 
 
 
283 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1192  hypothetical protein  34.23 
 
 
283 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539326  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2446  hypothetical protein  34.23 
 
 
283 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0026  hypothetical protein  40 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1378  hypothetical protein  42.25 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5196  hypothetical protein  34.58 
 
 
281 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1919  hypothetical protein  30.87 
 
 
281 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.303193 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6183  hypothetical protein  40 
 
 
281 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1896  hypothetical protein  40 
 
 
281 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>