81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1833 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1833  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1537  protein of unknown function DUF833  51.44 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5931  hypothetical protein  44.36 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.0182438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1933  hypothetical protein  43.88 
 
 		 246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112632  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4630  protein of unknown function DUF833  40.86 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.057436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2286  protein of unknown function DUF833  40.34 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000585883  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0180  protein of unknown function DUF833  34.56 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425571  normal  0.150181 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0713  hypothetical protein  32.81 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4216  hypothetical protein  36.57 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3748  hypothetical protein  28.98 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000326154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  72  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.401394  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0116  hypothetical protein  28.41 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.20644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0121  hypothetical protein  28.98 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0375691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1704  hypothetical protein  37.58 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4738  protein of unknown function DUF833  27.14 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2200  hypothetical protein  32.45 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0121  hypothetical protein  27.84 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4154  hypothetical protein  28.22 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1867  hypothetical protein  28 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0126  hypothetical protein  27.27 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4233  hypothetical protein  28.98 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5376  hypothetical protein  32.95 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0126  hypothetical protein  28.41 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0125  protein of unknown function DUF833  28.98 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0122  hypothetical protein  27.27 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0645812  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4437  hypothetical protein  26.7 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0121  hypothetical protein  28.41 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0090  hypothetical protein  28.8 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2311  hypothetical protein  30.26 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0043  hypothetical protein  29.38 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48200  hypothetical protein  41.9 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5197  hypothetical protein  32.02 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5144  hypothetical protein  31.46 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142216  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4830  hypothetical protein  26.14 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2329  hypothetical protein  31.33 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5051  hypothetical protein  31.46 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0321  hypothetical protein  31.82 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.839097  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1696  protein of unknown function DUF833  34.23 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187998 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1205  protein of unknown function DUF833  29.51 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2575  hypothetical protein  34.24 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1255  hypothetical protein  31.18 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3804  hypothetical protein  33.9 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0231  hypothetical protein  30.23 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3677  hypothetical protein  34.07 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1864  hypothetical protein  30.81 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0721  protein of unknown function DUF833  26.67 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144425  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0792  hypothetical protein  29.89 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3629  hypothetical protein  28.16 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2435  hypothetical protein  37.17 
 
 		 272 aa  52.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0432  hypothetical protein  31.43 
 
 		 251 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2522  hypothetical protein  28.26 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0545504  hitchhiker  0.00352676 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01011  hypothetical protein  34.67 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0890099  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2009  hypothetical protein  28.21 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0796  protein of unknown function DUF833  32.45 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4674  hypothetical protein  31.25 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0226025  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4017  hypothetical protein  25.56 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.312319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0734  protein of unknown function DUF833  37.33 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000353958 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2318  protein of unknown function DUF833  30.35 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.371027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04430  hypothetical protein  30.86 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0026  hypothetical protein  30.81 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2506  protein of unknown function DUF833  37.33 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.367832  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1780  putative signal peptide protein  31.07 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000400894  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1874  hypothetical protein  40.74 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3818  protein of unknown function DUF833  33.52 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2245  hypothetical protein  36.21 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3735  protein of unknown function DUF833  32.39 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.451552  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3553  protein of unknown function DUF833  29.75 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0969  hypothetical protein  23.55 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1330  hypothetical protein  38.67 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480841  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1832  hypothetical protein  28.49 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869889  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0589  hypothetical protein  32 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2151  hypothetical protein  41.03 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358972  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2166  protein of unknown function DUF833  27.72 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1772  protein of unknown function DUF833  29.14 
 
 		 265 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1192  hypothetical protein  40.26 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539326  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2323  hypothetical protein  40.26 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2446  hypothetical protein  40.26 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2284  hypothetical protein  40.26 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0642523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3385  hypothetical protein  40.26 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1919  hypothetical protein  40.26 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1429  protein of unknown function DUF833  29.61 
 
 		 271 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235139  normal  0.119665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>