77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57105 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_57105  predicted protein  100 
 
 
339 aa  701    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.669873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0792  hypothetical protein  27.24 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00340  conserved hypothetical protein  25.35 
 
 
331 aa  86.3  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4017  hypothetical protein  25.29 
 
 
255 aa  86.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.312319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0734  protein of unknown function DUF833  26.46 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000353958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0721  protein of unknown function DUF833  25.62 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0589  hypothetical protein  26.42 
 
 
263 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0231  hypothetical protein  26.81 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1867  hypothetical protein  27.24 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1205  protein of unknown function DUF833  25.95 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1430  hypothetical protein  27.11 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.09598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1255  hypothetical protein  26.22 
 
 
258 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129469  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01011  hypothetical protein  24.68 
 
 
260 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0890099  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2245  hypothetical protein  24.4 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3629  hypothetical protein  42.06 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06058  DUF833 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09530)  24.84 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.695721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0026  hypothetical protein  22.96 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2506  protein of unknown function DUF833  38.89 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.367832  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3748  hypothetical protein  39 
 
 
268 aa  67  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000326154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2200  hypothetical protein  32.06 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0969  hypothetical protein  24.48 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4154  hypothetical protein  42.67 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2435  hypothetical protein  25 
 
 
272 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2522  hypothetical protein  32.19 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0545504  hitchhiker  0.00352676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0122  hypothetical protein  45.95 
 
 
260 aa  63.5  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0645812  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0043  hypothetical protein  36.54 
 
 
249 aa  63.2  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4830  hypothetical protein  38.95 
 
 
252 aa  63.2  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0121  hypothetical protein  44.59 
 
 
267 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1864  hypothetical protein  24.52 
 
 
318 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0989733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0125  protein of unknown function DUF833  43.24 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4233  hypothetical protein  43.24 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4216  hypothetical protein  30.6 
 
 
248 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0126  hypothetical protein  43.24 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0121  hypothetical protein  41.89 
 
 
266 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4437  hypothetical protein  36.84 
 
 
253 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120022  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5197  hypothetical protein  24.53 
 
 
248 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2311  hypothetical protein  27.16 
 
 
274 aa  59.7  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1696  protein of unknown function DUF833  34.59 
 
 
267 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000187998 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0126  hypothetical protein  41.89 
 
 
266 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1429  protein of unknown function DUF833  38.16 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235139  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1470  protein of unknown function DUF833  38.16 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0397619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0116  hypothetical protein  40.54 
 
 
266 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.20644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0121  hypothetical protein  40.54 
 
 
266 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0375691 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0090  hypothetical protein  40.54 
 
 
258 aa  56.6  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1780  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
272 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000400894  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1874  hypothetical protein  24.19 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1330  hypothetical protein  36.63 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0593  protein of unknown function DUF833  22.96 
 
 
250 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1832  hypothetical protein  32.94 
 
 
284 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869889  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0266  hypothetical protein  37.5 
 
 
232 aa  52.8  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0321  hypothetical protein  37.5 
 
 
248 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.839097  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2166  protein of unknown function DUF833  34.29 
 
 
256 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5051  hypothetical protein  22.64 
 
 
248 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2009  hypothetical protein  27.87 
 
 
294 aa  49.7  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1040  hypothetical protein  27.41 
 
 
273 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0796  protein of unknown function DUF833  34.56 
 
 
277 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985351  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4674  hypothetical protein  32.22 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0226025  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5144  hypothetical protein  21.7 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142216  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1936  protein of unknown function DUF833  28.74 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751101  normal  0.504392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04430  hypothetical protein  29.17 
 
 
251 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2266  putative signal peptide protein  29.86 
 
 
281 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04376  hypothetical protein  32.67 
 
 
255 aa  46.2  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.982217  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2575  hypothetical protein  29.81 
 
 
257 aa  46.2  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0432  hypothetical protein  29.17 
 
 
251 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4738  protein of unknown function DUF833  33.62 
 
 
277 aa  46.2  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3020  hypothetical protein  34.04 
 
 
239 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.401394  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3804  hypothetical protein  32.88 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1378  hypothetical protein  33.67 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48200  hypothetical protein  29.17 
 
 
250 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1896  hypothetical protein  30.91 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2318  protein of unknown function DUF833  31.11 
 
 
244 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.371027 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6183  hypothetical protein  30.91 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1833  hypothetical protein  31.19 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1805  hypothetical protein  31.19 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0126825  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1919  hypothetical protein  30.91 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.303193 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2329  hypothetical protein  26.67 
 
 
278 aa  43.1  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.465577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5196  hypothetical protein  31.19 
 
 
281 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>