77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00340 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC00340  conserved hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  673    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0792  hypothetical protein  31.49 
 
 
256 aa  92.8  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57105  predicted protein  24.87 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.669873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5051  hypothetical protein  30.29 
 
 
248 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0589  hypothetical protein  27.97 
 
 
263 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5197  hypothetical protein  29.45 
 
 
248 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5144  hypothetical protein  30.29 
 
 
248 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142216  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0721  protein of unknown function DUF833  31.6 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0734  protein of unknown function DUF833  30.72 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000353958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4017  hypothetical protein  27.27 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.312319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1255  hypothetical protein  28.27 
 
 
258 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129469  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1867  hypothetical protein  26.86 
 
 
254 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0321  hypothetical protein  28.8 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.839097  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5376  hypothetical protein  28.06 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4216  hypothetical protein  34.13 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0090  hypothetical protein  26.47 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1864  hypothetical protein  29.1 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0989733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1874  hypothetical protein  29.77 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01011  hypothetical protein  25.32 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0890099  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2506  protein of unknown function DUF833  27.67 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.367832  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0121  hypothetical protein  25.99 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2200  hypothetical protein  29.35 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0026  hypothetical protein  27.41 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1205  protein of unknown function DUF833  28.66 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2245  hypothetical protein  26.38 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0231  hypothetical protein  28.48 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1696  protein of unknown function DUF833  26.84 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000187998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1430  hypothetical protein  26.87 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.09598  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2435  hypothetical protein  25.16 
 
 
272 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0116  hypothetical protein  26.64 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.20644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2522  hypothetical protein  27.35 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0545504  hitchhiker  0.00352676 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0043  hypothetical protein  25.99 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0122  hypothetical protein  24.23 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0645812  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0121  hypothetical protein  28.57 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0375691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0593  protein of unknown function DUF833  26.05 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0121  hypothetical protein  29.02 
 
 
267 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0126  hypothetical protein  24.67 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3748  hypothetical protein  29.96 
 
 
268 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000326154 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0969  hypothetical protein  24.84 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4674  hypothetical protein  26.71 
 
 
248 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0226025  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2151  hypothetical protein  30.23 
 
 
283 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4437  hypothetical protein  28.9 
 
 
253 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120022  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06058  DUF833 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09530)  27.85 
 
 
311 aa  62.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.695721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0126  hypothetical protein  27.23 
 
 
267 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4233  hypothetical protein  27.23 
 
 
267 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1470  protein of unknown function DUF833  26.51 
 
 
271 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0397619 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6183  hypothetical protein  28.64 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0125  protein of unknown function DUF833  27.23 
 
 
267 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1896  hypothetical protein  28.64 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1833  hypothetical protein  26.89 
 
 
281 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1429  protein of unknown function DUF833  26.51 
 
 
271 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235139  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1805  hypothetical protein  27.27 
 
 
281 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0126825  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2166  protein of unknown function DUF833  28.89 
 
 
256 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3629  hypothetical protein  27.85 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1832  hypothetical protein  28.22 
 
 
284 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869889  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2284  hypothetical protein  30.56 
 
 
283 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0642523  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1780  putative signal peptide protein  26.98 
 
 
272 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000400894  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2446  hypothetical protein  30.56 
 
 
283 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3385  hypothetical protein  30.56 
 
 
283 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2323  hypothetical protein  30.56 
 
 
283 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1919  hypothetical protein  30.56 
 
 
283 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1192  hypothetical protein  30.56 
 
 
283 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04430  hypothetical protein  30.52 
 
 
251 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1919  hypothetical protein  28.18 
 
 
281 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.303193 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1040  hypothetical protein  28.82 
 
 
273 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1378  hypothetical protein  26.87 
 
 
281 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2266  putative signal peptide protein  27.51 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0432  hypothetical protein  30.99 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4830  hypothetical protein  25.57 
 
 
252 aa  57.4  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5196  hypothetical protein  28.11 
 
 
281 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1936  protein of unknown function DUF833  28.03 
 
 
285 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751101  normal  0.504392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4154  hypothetical protein  27.03 
 
 
258 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04376  hypothetical protein  25.58 
 
 
255 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.982217  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26585  predicted protein  23.94 
 
 
406 aa  54.3  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1330  hypothetical protein  30.49 
 
 
266 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48200  hypothetical protein  28.84 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2311  hypothetical protein  29.53 
 
 
274 aa  42.7  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.986633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>