79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0880 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0880  protein of unknown function DUF833  100 
 
 		 179 aa  379  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0969  hypothetical protein  78.53 
 
 		 285 aa  305  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1430  hypothetical protein  47.75 
 
 		 275 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.09598  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1832  hypothetical protein  46.07 
 
 		 284 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869889  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1780  putative signal peptide protein  50.3 
 
 		 272 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000400894  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1470  protein of unknown function DUF833  48.5 
 
 		 271 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0397619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1429  protein of unknown function DUF833  47.9 
 
 		 271 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235139  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0792  hypothetical protein  38.89 
 
 		 256 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1205  protein of unknown function DUF833  40.12 
 
 		 256 aa  111  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0589  hypothetical protein  39.29 
 
 		 263 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2166  protein of unknown function DUF833  39.76 
 
 		 256 aa  104  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0432  hypothetical protein  39.88 
 
 		 251 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1192  hypothetical protein  37.06 
 
 		 283 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539326  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2284  hypothetical protein  37.06 
 
 		 283 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0642523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3385  hypothetical protein  37.06 
 
 		 283 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1919  hypothetical protein  37.06 
 
 		 283 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2323  hypothetical protein  37.06 
 
 		 283 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2446  hypothetical protein  37.06 
 
 		 283 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1919  hypothetical protein  37.06 
 
 		 281 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.303193 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6183  hypothetical protein  37.06 
 
 		 281 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1896  hypothetical protein  37.06 
 
 		 281 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2245  hypothetical protein  33.93 
 
 		 269 aa  101  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48200  hypothetical protein  38.73 
 
 		 250 aa  101  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2151  hypothetical protein  36.16 
 
 		 283 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358972  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1255  hypothetical protein  36.54 
 
 		 258 aa  99  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2200  hypothetical protein  39.29 
 
 		 249 aa  97.8  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1805  hypothetical protein  36.91 
 
 		 281 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0126825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1833  hypothetical protein  36.24 
 
 		 281 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0231  hypothetical protein  33.53 
 
 		 261 aa  96.3  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01011  hypothetical protein  39.1 
 
 		 260 aa  95.9  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0890099  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1936  protein of unknown function DUF833  34.12 
 
 		 285 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751101  normal  0.504392 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1378  hypothetical protein  37.58 
 
 		 281 aa  94.7  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5196  hypothetical protein  37.65 
 
 		 281 aa  94.4  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0593  protein of unknown function DUF833  34.97 
 
 		 250 aa  92.8  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0734  protein of unknown function DUF833  35.12 
 
 		 258 aa  92.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000353958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4216  hypothetical protein  34.68 
 
 		 248 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5144  hypothetical protein  36.31 
 
 		 248 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142216  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5051  hypothetical protein  36.31 
 
 		 248 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5197  hypothetical protein  36.47 
 
 		 248 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2506  protein of unknown function DUF833  37.99 
 
 		 266 aa  91.3  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.367832  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1040  hypothetical protein  35.57 
 
 		 273 aa  91.3  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0026  hypothetical protein  33.71 
 
 		 254 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0721  protein of unknown function DUF833  43.52 
 
 		 258 aa  89.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144425  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2266  putative signal peptide protein  33.14 
 
 		 281 aa  87.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04430  hypothetical protein  35.84 
 
 		 251 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1864  hypothetical protein  38.71 
 
 		 318 aa  87.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0321  hypothetical protein  35.12 
 
 		 248 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.839097  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5376  hypothetical protein  34.52 
 
 		 248 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4017  hypothetical protein  36.49 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.312319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2522  hypothetical protein  40.67 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0545504  hitchhiker  0.00352676 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4154  hypothetical protein  33.74 
 
 		 258 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3748  hypothetical protein  30.18 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000326154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1330  hypothetical protein  31.43 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1874  hypothetical protein  36.42 
 
 		 319 aa  78.6  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2575  hypothetical protein  42.45 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3629  hypothetical protein  31.61 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4437  hypothetical protein  33.03 
 
 		 253 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120022  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0126  hypothetical protein  33.03 
 
 		 266 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0122  hypothetical protein  37.61 
 
 		 260 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0645812  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0121  hypothetical protein  33.94 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0375691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4830  hypothetical protein  28.05 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0116  hypothetical protein  33.94 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.20644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4233  hypothetical protein  33.94 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0125  protein of unknown function DUF833  35.14 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0121  hypothetical protein  33.94 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0126  hypothetical protein  33.94 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0121  hypothetical protein  33.94 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0090  hypothetical protein  30.06 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2435  hypothetical protein  35.09 
 
 		 272 aa  68.2  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1867  hypothetical protein  25.31 
 
 		 254 aa  64.3  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4674  hypothetical protein  32.68 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0226025  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1696  protein of unknown function DUF833  28.57 
 
 		 267 aa  61.6  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04376  hypothetical protein  30.7 
 
 		 255 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.982217  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2329  hypothetical protein  26.34 
 
 		 278 aa  48.5  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465577 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2009  hypothetical protein  27.01 
 
 		 294 aa  47  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0266  hypothetical protein  28.29 
 
 		 232 aa  44.7  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2311  hypothetical protein  26.04 
 
 		 274 aa  43.9  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26585  predicted protein  35.29 
 
 		 406 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>