More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1946 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1946  ABC transporter related  100 
 
 		 353 aa  717    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2479  ABC transporter related  66.95 
 
 		 339 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2734  ABC transporter related  66.29 
 
 		 339 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.367354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0122  ABC transporter related  47.5 
 
 		 347 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3233  ABC transporter related  50.7 
 
 		 344 aa  315  7e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.611679  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0542  ABC transporter related  46.05 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.999499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1465  ABC transporter related  45.68 
 
 		 371 aa  282  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.778579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3201  ABC transporter component  46.28 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1077  ABC transporter related  47.5 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 363 aa  250  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2873  ABC transporter related  46.41 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204327 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  46.95 
 
 		 369 aa  246  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5570  ABC transporter related protein  52.26 
 
 		 365 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  43.54 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.13 
 
 		 354 aa  242  7.999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1606  ABC transporter related  43.33 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  40.23 
 
 		 349 aa  239  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4361  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.1 
 
 		 362 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000264978  normal  0.276396 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0297  ABC transporter related  43.35 
 
 		 359 aa  238  8e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.292775  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  36.48 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.18 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  42.68 
 
 		 352 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  48.97 
 
 		 366 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  48.16 
 
 		 365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.71 
 
 		 363 aa  235  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  40.63 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  42.86 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  43.12 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  45.04 
 
 		 363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  39.81 
 
 		 359 aa  233  5e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.19 
 
 		 353 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  40.3 
 
 		 347 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  43.64 
 
 		 377 aa  232  7.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2287  ABC transporter related  40.13 
 
 		 362 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  39.68 
 
 		 367 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.42 
 
 		 372 aa  232  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 355 aa  232  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.98 
 
 		 372 aa  232  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  50.2 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  42.63 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  40.92 
 
 		 370 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.19 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2238  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 384 aa  230  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  43.49 
 
 		 347 aa  230  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  47.98 
 
 		 356 aa  230  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  45.53 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  46.53 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  46.74 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.33 
 
 		 357 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  44.44 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.19 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 373 aa  229  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.69 
 
 		 395 aa  229  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.82 
 
 		 368 aa  229  8e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  48.51 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.4 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.51 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  40 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  43.89 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.81 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000472739  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.1 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647978 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  45.71 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 423 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  44.98 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  39.69 
 
 		 372 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.93 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.68 
 
 		 374 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  43.3 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  48.19 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.98 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  47.76 
 
 		 366 aa  227  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2153  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.26 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200708  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6541  ABC transporter related  42.65 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131089 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.9 
 
 		 354 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3962  ABC transporter related  47.18 
 
 		 378 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  50.23 
 
 		 369 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  47.97 
 
 		 363 aa  226  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  45.65 
 
 		 374 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5592  ABC transporter related  38.91 
 
 		 358 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.65 
 
 		 374 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.98 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 353 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  37.18 
 
 		 349 aa  226  4e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  49.2 
 
 		 367 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4791  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.29 
 
 		 374 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1416  ABC transporter related  48.19 
 
 		 347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  45.31 
 
 		 363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.41 
 
 		 377 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.6 
 
 		 357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0289  ABC transporter ATP-binding protein  41.54 
 
 		 370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  48.43 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.94 
 
 		 356 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1465  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  44.34 
 
 		 352 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476678  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  46.12 
 
 		 368 aa  226  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 		 365 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  41.42 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.56 
 
 		 357 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6322  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.32 
 
 		 385 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0819115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>