More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3597 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3597  Peptidase M23  100 
 
 		 221 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  0.0478878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3924  Peptidase M23  55.5 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1253  Peptidase M23  50.47 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.118711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2800  peptidase M23B  44.91 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09121  putative enzyme with aminotransferase class-III domain protein  42.2 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  35.9 
 
 		 994 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  37.35 
 
 		 1003 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  39.85 
 
 		 1016 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  35.33 
 
 		 1015 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1018 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  34.73 
 
 		 1015 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  39.1 
 
 		 1023 aa  94  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  34.3 
 
 		 1015 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  39.1 
 
 		 1049 aa  93.2  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  31.93 
 
 		 978 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44932  predicted protein  29.71 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996526  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  32.04 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  28.5 
 
 		 533 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  32.77 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  31.9 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  37.62 
 
 		 503 aa  55.5  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  33.33 
 
 		 324 aa  54.3  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  32.71 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.36 
 
 		 554 aa  54.3  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  37.62 
 
 		 479 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.35 
 
 		 547 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  35.34 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  33.96 
 
 		 999 aa  52.8  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  34.06 
 
 		 448 aa  52.4  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1296  tyrosyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 456 aa  52.4  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000911619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  30.1 
 
 		 293 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  32.84 
 
 		 388 aa  52.4  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0282  Peptidase M23  34.65 
 
 		 263 aa  52  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.178127  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0592  M23/M37 familypeptidase  37.86 
 
 		 282 aa  51.6  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.181185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1104  peptidase M23B  35.71 
 
 		 444 aa  51.6  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109344  decreased coverage  0.00201556 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  31.78 
 
 		 301 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  32.11 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  33.07 
 
 		 503 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  32.46 
 
 		 325 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  30.43 
 
 		 402 aa  51.2  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  37.5 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  36.63 
 
 		 377 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  33.6 
 
 		 390 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3569  Peptidase M23  36.28 
 
 		 448 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3500  peptidase M23B  36.28 
 
 		 448 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  35.51 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  32.67 
 
 		 454 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.32 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1772  M23/M37 familypeptidase  37.76 
 
 		 327 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  36 
 
 		 482 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4161  Peptidase M23  33.33 
 
 		 261 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000379342  normal  0.306155 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  27.97 
 
 		 312 aa  50.1  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1277  Peptidase M23  33 
 
 		 431 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376949  normal  0.138008 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  35.35 
 
 		 300 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  31.25 
 
 		 306 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  30 
 
 		 447 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  37.11 
 
 		 385 aa  50.1  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  32.76 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  30 
 
 		 447 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  37.14 
 
 		 388 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  32.67 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  35.35 
 
 		 441 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  33.98 
 
 		 374 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  38.83 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  34.51 
 
 		 433 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  35.05 
 
 		 352 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  32 
 
 		 316 aa  49.3  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  36.08 
 
 		 249 aa  49.3  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  31.78 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  34 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  36.36 
 
 		 464 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  30.19 
 
 		 300 aa  48.9  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  32.38 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  30.7 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  34.45 
 
 		 290 aa  49.3  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  34 
 
 		 323 aa  48.9  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0217  peptidase, M23/M37 family  31.75 
 
 		 459 aa  48.9  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000191836  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  37.37 
 
 		 464 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  30.08 
 
 		 296 aa  48.9  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  35.92 
 
 		 283 aa  48.9  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  29.9 
 
 		 424 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  29.9 
 
 		 421 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  37.25 
 
 		 441 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  38.14 
 
 		 303 aa  48.1  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  35.35 
 
 		 312 aa  48.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  36.08 
 
 		 425 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  33.03 
 
 		 421 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  30.61 
 
 		 406 aa  48.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  33.03 
 
 		 421 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  28.21 
 
 		 307 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  33.03 
 
 		 400 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  30.16 
 
 		 473 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  29.25 
 
 		 300 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  34.55 
 
 		 420 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  37 
 
 		 347 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  33.03 
 
 		 412 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  29.13 
 
 		 468 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  31.07 
 
 		 325 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  37.11 
 
 		 347 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  33.33 
 
 		 314 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>