225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09121 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09121  putative enzyme with aminotransferase class-III domain protein  100 
 
 
231 aa  473  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.278275  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2800  peptidase M23B  51.35 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3597  Peptidase M23  42.2 
 
 
221 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  0.0478878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1253  Peptidase M23  42.72 
 
 
224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.118711  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3924  Peptidase M23  40.85 
 
 
224 aa  169  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  38.79 
 
 
994 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  37.5 
 
 
1003 aa  105  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  35.1 
 
 
1016 aa  90.1  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  34.51 
 
 
1018 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  30.94 
 
 
1015 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  32.09 
 
 
1015 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  31.54 
 
 
1015 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  32.45 
 
 
1023 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  31.79 
 
 
1049 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  36.89 
 
 
374 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06251  M23/M37 familypeptidase  37.12 
 
 
323 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0447795 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  37.04 
 
 
324 aa  59.7  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44932  predicted protein  30.64 
 
 
280 aa  59.3  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996526  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  36.19 
 
 
323 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  36.54 
 
 
999 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.69 
 
 
321 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1772  M23/M37 familypeptidase  37.59 
 
 
327 aa  57  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  35.4 
 
 
309 aa  56.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  27.46 
 
 
978 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  33.6 
 
 
523 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  36.08 
 
 
377 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  31.78 
 
 
333 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  37.17 
 
 
388 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  33 
 
 
554 aa  53.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  33.96 
 
 
337 aa  53.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  31.5 
 
 
347 aa  52.8  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  31.06 
 
 
379 aa  52.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  31.78 
 
 
333 aa  52  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  35.43 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  33.33 
 
 
376 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  33 
 
 
529 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  33.33 
 
 
687 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  36.67 
 
 
265 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  35.35 
 
 
362 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1104  peptidase M23B  31.3 
 
 
444 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109344  decreased coverage  0.00201556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0287  Peptidase M23  35.51 
 
 
297 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  33 
 
 
303 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  32.52 
 
 
377 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  31.82 
 
 
363 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  26.78 
 
 
316 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  29.41 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  31.29 
 
 
273 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0242  Peptidase M23  33.33 
 
 
456 aa  49.3  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  26.11 
 
 
378 aa  49.3  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  34.65 
 
 
314 aa  49.3  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  31.86 
 
 
325 aa  49.3  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  27.95 
 
 
275 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  30.91 
 
 
271 aa  49.3  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  33.33 
 
 
316 aa  48.9  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  32.65 
 
 
360 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  32.74 
 
 
352 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  32.65 
 
 
360 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  37.25 
 
 
582 aa  48.9  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  32.65 
 
 
360 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  34.34 
 
 
247 aa  48.5  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  33.01 
 
 
282 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  29.34 
 
 
274 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  34.31 
 
 
367 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  33.01 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.14 
 
 
303 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0282  Peptidase M23  35 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.178127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  28.99 
 
 
433 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  32.71 
 
 
300 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  33.33 
 
 
305 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  33.33 
 
 
305 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  32.86 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  30.71 
 
 
299 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  33.02 
 
 
347 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  34.34 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  35.14 
 
 
334 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  35.51 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  34.31 
 
 
323 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  31.19 
 
 
295 aa  47.4  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  32.33 
 
 
484 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  33.33 
 
 
305 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1457  peptidase M23B  34.31 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  29.13 
 
 
275 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  33.33 
 
 
301 aa  47  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  37.76 
 
 
308 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  29.13 
 
 
275 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0253  Peptidase M23  37.18 
 
 
289 aa  46.6  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.315574  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  34.34 
 
 
388 aa  46.6  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  31.25 
 
 
301 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  34.51 
 
 
322 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0954  peptidase M23B  34.17 
 
 
433 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000982445  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  29.13 
 
 
275 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  34.02 
 
 
727 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  27.08 
 
 
421 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  34.02 
 
 
727 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  27.08 
 
 
424 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  31.78 
 
 
299 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  30.1 
 
 
341 aa  45.8  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  34.38 
 
 
284 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  36 
 
 
751 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  30.83 
 
 
324 aa  46.2  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>