222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3924 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3924  Peptidase M23  100 
 
 		 224 aa  462  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3597  Peptidase M23  55.5 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  0.0478878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1253  Peptidase M23  50.9 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.118711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2800  peptidase M23B  44.5 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09121  putative enzyme with aminotransferase class-III domain protein  40.85 
 
 		 231 aa  169  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  39.78 
 
 		 994 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  38.27 
 
 		 1003 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  35.58 
 
 		 1018 aa  96.3  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  32.72 
 
 		 1016 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  33.95 
 
 		 1015 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  33.95 
 
 		 1015 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  34.84 
 
 		 1023 aa  91.7  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1015 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  34.84 
 
 		 1049 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  32.08 
 
 		 978 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44932  predicted protein  33.33 
 
 		 280 aa  65.1  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996526  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  36.67 
 
 		 503 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  32.28 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.71 
 
 		 554 aa  55.1  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  34 
 
 		 309 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  34.65 
 
 		 374 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  41 
 
 		 375 aa  53.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  36.36 
 
 		 388 aa  52  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  36.36 
 
 		 411 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.34 
 
 		 547 aa  52  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1795  Peptidase M23  31.63 
 
 		 327 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  37.62 
 
 		 323 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  36.19 
 
 		 282 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  36.73 
 
 		 412 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  34.74 
 
 		 472 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  34.31 
 
 		 425 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  35.29 
 
 		 441 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  35.71 
 
 		 425 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  33.68 
 
 		 475 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  30.3 
 
 		 378 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  34.31 
 
 		 400 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  34.31 
 
 		 421 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  28.46 
 
 		 414 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000291008  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  33.98 
 
 		 350 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  33.68 
 
 		 473 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  34.31 
 
 		 421 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  36.54 
 
 		 324 aa  49.7  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  34.4 
 
 		 307 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1554  M24/M37 family peptidase  29.69 
 
 		 423 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000152765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1592  peptidase, M23/M37 family  29.69 
 
 		 423 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1339  M24/M37 family peptidase  29.69 
 
 		 417 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1314  cell wall endopeptidase  29.69 
 
 		 423 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1313  cell wall endopeptidase  29.69 
 
 		 423 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309784  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  34.31 
 
 		 420 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  33.91 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1449  M23/37 family peptidase  29.69 
 
 		 417 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000128519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1523  peptidase, M23/M37 family  29.69 
 
 		 423 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.25649e-59 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  33.98 
 
 		 350 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  36.54 
 
 		 291 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  33.68 
 
 		 473 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  28.46 
 
 		 424 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  34.62 
 
 		 377 aa  49.3  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  35.29 
 
 		 431 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  33 
 
 		 305 aa  49.3  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  35.35 
 
 		 305 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  34.34 
 
 		 305 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  36.45 
 
 		 269 aa  48.9  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  37.23 
 
 		 388 aa  48.9  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  33.65 
 
 		 271 aa  48.5  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0898  peptidase M23B  29.41 
 
 		 264 aa  48.9  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.206308 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  33.66 
 
 		 271 aa  48.5  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  35.35 
 
 		 305 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  35.35 
 
 		 305 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.67 
 
 		 321 aa  48.1  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  31.31 
 
 		 319 aa  48.5  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  27.64 
 
 		 424 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  36.36 
 
 		 482 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  38.3 
 
 		 389 aa  47.8  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  31.63 
 
 		 406 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  31.9 
 
 		 999 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  35.11 
 
 		 385 aa  48.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  34.95 
 
 		 314 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  34.23 
 
 		 459 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  27.64 
 
 		 421 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  31.37 
 
 		 363 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  26.85 
 
 		 603 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  26.85 
 
 		 603 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  29.5 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  34.34 
 
 		 317 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  35.42 
 
 		 347 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  36 
 
 		 610 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  32 
 
 		 328 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  35.09 
 
 		 303 aa  46.6  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  34.34 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  32.04 
 
 		 377 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  31.31 
 
 		 302 aa  46.6  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  33.68 
 
 		 474 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  33.68 
 
 		 475 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  34.02 
 
 		 362 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  31.31 
 
 		 305 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  33.33 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0242  Peptidase M23  36.14 
 
 		 456 aa  46.2  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  31.58 
 
 		 447 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  29.41 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  23.08 
 
 		 564 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>