More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1253 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1253  Peptidase M23  100 
 
 		 224 aa  464  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.118711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3924  Peptidase M23  50.9 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3597  Peptidase M23  50.47 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  0.0478878 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2800  peptidase M23B  41.96 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09121  putative enzyme with aminotransferase class-III domain protein  42.72 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  37.78 
 
 		 994 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  40.76 
 
 		 1023 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  35.96 
 
 		 1049 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  37.42 
 
 		 1003 aa  104  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1016 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1015 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1015 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  32.94 
 
 		 1015 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  38.73 
 
 		 1018 aa  85.9  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44932  predicted protein  34.85 
 
 		 280 aa  71.6  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  32.06 
 
 		 978 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.13 
 
 		 554 aa  65.5  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  38.61 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.33 
 
 		 547 aa  62.4  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  40 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  38 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.36 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  38.24 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0801  peptidase, M23/M37 family  35.35 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70657e-48 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  35.35 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.2041900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  37 
 
 		 477 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  36.73 
 
 		 438 aa  55.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  32.67 
 
 		 503 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  35.64 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  26.72 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  30.54 
 
 		 475 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  33.9 
 
 		 362 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0779  peptidase, M23/M37 family  35.35 
 
 		 384 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000701566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  34.34 
 
 		 384 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 475 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  33.33 
 
 		 473 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0794  M24/M37 family peptidase  34.34 
 
 		 384 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000011526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  35.9 
 
 		 474 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0690  M24/M37 family peptidase  34.34 
 
 		 386 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000234103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  34.34 
 
 		 386 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000528425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  30.41 
 
 		 475 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0876  peptidase, M23/M37 family  34.34 
 
 		 386 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0724  M23/37 family peptidase  34.34 
 
 		 386 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000754893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  36.19 
 
 		 377 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  37.5 
 
 		 389 aa  53.9  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  33.33 
 
 		 473 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  40.4 
 
 		 323 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  37.5 
 
 		 385 aa  53.5  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  38.83 
 
 		 582 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  34.31 
 
 		 695 aa  52.8  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  28.7 
 
 		 603 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  37.5 
 
 		 353 aa  52.8  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  36.08 
 
 		 464 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  29.29 
 
 		 590 aa  52.8  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  28.7 
 
 		 603 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  31.73 
 
 		 999 aa  53.1  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  36.46 
 
 		 388 aa  52.4  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  38.78 
 
 		 347 aa  52  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  33.96 
 
 		 324 aa  52  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  32.2 
 
 		 468 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  32.28 
 
 		 464 aa  51.6  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  37.37 
 
 		 523 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  33.33 
 
 		 386 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  31.62 
 
 		 447 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  39.09 
 
 		 751 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  30.21 
 
 		 414 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000291008  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  39 
 
 		 482 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  36.19 
 
 		 347 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  34.91 
 
 		 441 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  28.21 
 
 		 430 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0465  Peptidase M23  29.03 
 
 		 347 aa  50.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.817942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  37.11 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  36.08 
 
 		 464 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  31.65 
 
 		 682 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  29.7 
 
 		 271 aa  49.3  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  30.43 
 
 		 325 aa  49.3  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  32.32 
 
 		 569 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  32.81 
 
 		 377 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  31.68 
 
 		 517 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  35.64 
 
 		 484 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1627  M24/M37 family peptidase  35.71 
 
 		 386 aa  48.9  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  31.96 
 
 		 300 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  33.64 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  34.29 
 
 		 379 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  33.33 
 
 		 457 aa  48.5  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  33.67 
 
 		 467 aa  48.9  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  37.5 
 
 		 388 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  35.05 
 
 		 459 aa  48.5  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  30 
 
 		 302 aa  48.5  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  36.36 
 
 		 513 aa  48.9  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  38.54 
 
 		 303 aa  48.5  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  35.71 
 
 		 386 aa  48.5  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  38.14 
 
 		 346 aa  48.5  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  32.69 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  34.62 
 
 		 431 aa  48.5  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  36.73 
 
 		 376 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  30.97 
 
 		 299 aa  48.5  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  33.33 
 
 		 305 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  38.14 
 
 		 270 aa  48.5  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  29.7 
 
 		 295 aa  48.5  0.00009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>