168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1973 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2028  integrase family protein  98.34 
 
 		 422 aa  866    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0404622  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3391  integrase family protein  98.82 
 
 		 422 aa  867    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3487  integrase family protein  98.1 
 
 		 422 aa  863    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0968357  unclonable  0.00000880604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1978  integrase family protein  98.82 
 
 		 422 aa  869    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000635719  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1861  phage integrase family protein  97.39 
 
 		 422 aa  858    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00488759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1973  phage integrase family protein  100 
 
 		 422 aa  879    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2555  phage integrase family protein  97.16 
 
 		 422 aa  858    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3254  phage integrase family protein  98.34 
 
 		 422 aa  866    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3363  phage integrase family protein  98.1 
 
 		 422 aa  863    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.267116  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3261  phage integrase  68.75 
 
 		 417 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0304734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3610  phage integrase family protein  66.75 
 
 		 418 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0775  integrase family protein  66.51 
 
 		 418 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0745  phage integrase family protein  66.51 
 
 		 418 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0772  integrase family protein  66.27 
 
 		 418 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.045428  normal  0.308658 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1655  phage integrase family protein  56.56 
 
 		 420 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0191595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4354  integrase family protein  33.67 
 
 		 445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0248698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2610  integrase family protein  30.57 
 
 		 411 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3889  phage integrase, putative  33.16 
 
 		 432 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000353876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2978  prophage LambdaSo, site-specific recombinase phage integrase family protein  31.09 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1555  phage integrase, putative  32.41 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.206278  decreased coverage  0.0000047649 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0405  phage integrase family protein  30.6 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.629501  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4126  phage integrase family protein  32.74 
 
 		 432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.727989  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  28.19 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  28.76 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  26.26 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1581  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638214  normal  0.178566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  24.52 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  26.55 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  23.57 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  25.29 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  27.07 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  25.93 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  21.37 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  26.32 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  22.05 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  23.96 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1914  integrative genetic element Gsu32, integrase, putative  25.56 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409637  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  21.84 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  22.27 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  24.67 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  24.91 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  21.9 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  22.87 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  23.26 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  23.16 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  25.7 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  24.2 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  23.69 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  26.59 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  21.51 
 
 		 439 aa  57  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  21.81 
 
 		 419 aa  57  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  28.24 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1878  putative integrase  22.47 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184819 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  25.45 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3239  integrase family protein  23.62 
 
 		 424 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0978515  normal  0.26506 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  22.89 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  24.83 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  23.41 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  26.83 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01627  integrase  26.64 
 
 		 290 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  25.94 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  23.1 
 
 		 515 aa  55.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  24.62 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  24.07 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  24.71 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  24.7 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  22.03 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  24.12 
 
 		 418 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  22.38 
 
 		 443 aa  53.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  22.9 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  23.9 
 
 		 432 aa  53.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  22.22 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  25.12 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  23.86 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.99 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  21.38 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  24.05 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  23.35 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  27.75 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  27.82 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  25.87 
 
 		 417 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  21.79 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  29.77 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  23 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  24.71 
 
 		 446 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  21.71 
 
 		 418 aa  50.4  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  23.75 
 
 		 381 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  20.92 
 
 		 425 aa  50.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  26.81 
 
 		 390 aa  50.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  23.92 
 
 		 394 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  23.2 
 
 		 409 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  25.59 
 
 		 419 aa  50.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  25.89 
 
 		 395 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  23.03 
 
 		 406 aa  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  22.22 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  22.08 
 
 		 420 aa  49.7  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  21.63 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0824  site-specific recombinase, phage integrase family  25.38 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.966036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>