201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2610 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2978  prophage LambdaSo, site-specific recombinase phage integrase family protein  83.63 
 
 		 399 aa  710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2610  integrase family protein  100 
 
 		 411 aa  850    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3889  phage integrase, putative  39.8 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000353876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4354  integrase family protein  38.68 
 
 		 445 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0248698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4126  phage integrase family protein  40.92 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.727989  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0405  phage integrase family protein  35.93 
 
 		 402 aa  276  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.629501  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1555  phage integrase, putative  35.66 
 
 		 423 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.206278  decreased coverage  0.0000047649 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1655  phage integrase family protein  35.05 
 
 		 420 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0191595  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3261  phage integrase  32.22 
 
 		 417 aa  192  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0304734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3610  phage integrase family protein  32.12 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842919  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0745  phage integrase family protein  32.23 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3363  phage integrase family protein  30.57 
 
 		 422 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.267116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0772  integrase family protein  32.23 
 
 		 418 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.045428  normal  0.308658 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1973  phage integrase family protein  30.57 
 
 		 422 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0775  integrase family protein  31.87 
 
 		 418 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2028  integrase family protein  30.57 
 
 		 422 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0404622  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3391  integrase family protein  30.57 
 
 		 422 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1861  phage integrase family protein  30.57 
 
 		 422 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00488759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2555  phage integrase family protein  30.57 
 
 		 422 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3487  integrase family protein  30.31 
 
 		 422 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0968357  unclonable  0.00000880604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1978  integrase family protein  30.31 
 
 		 422 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000635719  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3254  phage integrase family protein  30.31 
 
 		 422 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1581  hypothetical protein  34.43 
 
 		 168 aa  86.7  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638214  normal  0.178566 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  24.23 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  24.23 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  25.09 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  23.41 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  23.96 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  24.83 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  23.74 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  23.79 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  21.91 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  23.13 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  24.88 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  24.44 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  27.07 
 
 		 400 aa  67  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  24.13 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  29.41 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  23.3 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5642  Phage integrase  26.91 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0519  phage integrase  23.84 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  23.1 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  23.45 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  23.34 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  22.78 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  24.43 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  26.16 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01627  integrase  23.25 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  24.36 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  23.5 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  23.79 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  25.86 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  24.92 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  22.45 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  25.28 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  22.43 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  22.43 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  25.47 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  22.43 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  21.43 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  26.67 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  25.7 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5756  integrase family protein  22.27 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  23.79 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  23.05 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  20.27 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.03 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  22.71 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  24.69 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  23.47 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1277  putative phage integrase  26.67 
 
 		 454 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  21.12 
 
 		 432 aa  57  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 419 aa  57  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.82 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  22.43 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  24.53 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  27.81 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  22.43 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  27.27 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  22.33 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  22.63 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  26.16 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  22.14 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  21.31 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3163  integrase family protein  23.02 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0193699 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  23.38 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3107  integrase  24.14 
 
 		 151 aa  53.5  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0236409  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  21.04 
 
 		 401 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  24.73 
 
 		 377 aa  53.1  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2957  integrase family protein  26.3 
 
 		 436 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  22.08 
 
 		 405 aa  53.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6370  integrase family protein  24.6 
 
 		 438 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  22.39 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  22.38 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  22.26 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  20.23 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  22.51 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  25 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  23.1 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>