More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4354 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4354  integrase family protein  100 
 
 		 445 aa  910    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0248698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3889  phage integrase, putative  47.34 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000353876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4126  phage integrase family protein  48.86 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.727989  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1555  phage integrase, putative  47.06 
 
 		 423 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.206278  decreased coverage  0.0000047649 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2610  integrase family protein  38.68 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2978  prophage LambdaSo, site-specific recombinase phage integrase family protein  37.63 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0405  phage integrase family protein  34.41 
 
 		 402 aa  233  6e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.629501  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0745  phage integrase family protein  37.91 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0772  integrase family protein  37.91 
 
 		 418 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.045428  normal  0.308658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0775  integrase family protein  37.66 
 
 		 418 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3610  phage integrase family protein  37.66 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1655  phage integrase family protein  34.55 
 
 		 420 aa  209  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0191595  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3261  phage integrase  35.62 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0304734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1861  phage integrase family protein  33.67 
 
 		 422 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00488759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2028  integrase family protein  33.67 
 
 		 422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0404622  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1973  phage integrase family protein  33.67 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3391  integrase family protein  33.67 
 
 		 422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2555  phage integrase family protein  33.67 
 
 		 422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3363  phage integrase family protein  33.42 
 
 		 422 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.267116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1978  integrase family protein  33.42 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000635719  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3254  phage integrase family protein  33.42 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3487  integrase family protein  33.42 
 
 		 422 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0968357  unclonable  0.00000880604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  26.35 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  24.7 
 
 		 416 aa  93.2  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3163  integrase family protein  28.36 
 
 		 429 aa  87  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0193699 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  27.38 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  28.73 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.11 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.95 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  27.24 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  27.47 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  27.41 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.47 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  25.17 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  27.41 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  28.41 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  25.98 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  26.62 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  24.57 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  26.17 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  26.16 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  25.84 
 
 		 409 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  25.84 
 
 		 409 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  28.25 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  27.34 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  26.24 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  25.45 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  23.53 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  25.18 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  25.26 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  25.81 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  26.84 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  28.63 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  26.94 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  26.42 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  26.56 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  27.41 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  26.37 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  25.56 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  25.5 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  32.31 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  26.87 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  25.32 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  26.1 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  26.44 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  26.55 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  26.12 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5756  integrase family protein  24.7 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  28.05 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0927  integrase family protein  26.43 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  23.35 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2191  Phage integrase  26.74 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  23.23 
 
 		 409 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  26.86 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  24.72 
 
 		 413 aa  69.7  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  26.24 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  25.07 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  25.34 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  25.38 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1101  site-specific recombinase phage integrase family protein  25.21 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000786057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2957  integrase family protein  26.92 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01627  integrase  24.38 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  33.93 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  24.65 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  25.71 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  23.83 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  26.03 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  26.6 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  26.3 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  25 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  26.61 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  25.76 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  26.21 
 
 		 418 aa  67  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  26.6 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  28.47 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 416 aa  67  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2864  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  25 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>