167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1861 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3487  integrase family protein  98.34 
 
 		 422 aa  865    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0968357  unclonable  0.00000880604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2028  integrase family protein  98.58 
 
 		 422 aa  866    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0404622  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1978  integrase family protein  98.1 
 
 		 422 aa  863    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000635719  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3391  integrase family protein  98.1 
 
 		 422 aa  864    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1861  phage integrase family protein  100 
 
 		 422 aa  877    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00488759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1973  phage integrase family protein  97.39 
 
 		 422 aa  858    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2555  phage integrase family protein  98.1 
 
 		 422 aa  863    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3254  phage integrase family protein  98.58 
 
 		 422 aa  865    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3363  phage integrase family protein  97.87 
 
 		 422 aa  862    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.267116  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3261  phage integrase  68.99 
 
 		 417 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0304734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3610  phage integrase family protein  67.46 
 
 		 418 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0775  integrase family protein  67.22 
 
 		 418 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0772  integrase family protein  66.75 
 
 		 418 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.045428  normal  0.308658 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0745  phage integrase family protein  66.99 
 
 		 418 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1655  phage integrase family protein  57.04 
 
 		 420 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0191595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4354  integrase family protein  33.67 
 
 		 445 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0248698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3889  phage integrase, putative  33.42 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000353876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2610  integrase family protein  30.57 
 
 		 411 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2978  prophage LambdaSo, site-specific recombinase phage integrase family protein  31.09 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1555  phage integrase, putative  32.23 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.206278  decreased coverage  0.0000047649 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0405  phage integrase family protein  30.6 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.629501  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4126  phage integrase family protein  32.75 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.727989  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  28.19 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  28.76 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  26.26 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1581  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638214  normal  0.178566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  24.9 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  25.29 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  23.57 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  26.55 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  21.37 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1914  integrative genetic element Gsu32, integrase, putative  25.44 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  26.43 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  22.66 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  26.75 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  24.28 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  21.84 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  22.27 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  24.66 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  24.88 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  22.7 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  23.16 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  21.9 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  24.53 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  21.51 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  26.59 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  22.87 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  21.46 
 
 		 419 aa  57  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  24.23 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  25.45 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3239  integrase family protein  23.57 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0978515  normal  0.26506 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  23.2 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01627  integrase  26.64 
 
 		 290 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  25.3 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  23.47 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  25.38 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  24.91 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  22.59 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  26.83 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1878  putative integrase  22.25 
 
 		 425 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  24.9 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  25.59 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  24.25 
 
 		 394 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  25.48 
 
 		 418 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  21.15 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  27.65 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  25.94 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  24.13 
 
 		 393 aa  53.5  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  24.48 
 
 		 389 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  23.66 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 432 aa  53.1  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  22.38 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  27.54 
 
 		 390 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  26.42 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  22.73 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  25 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.34 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  27.75 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  22.22 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  23.35 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  29.77 
 
 		 391 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  27.82 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  24.05 
 
 		 455 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  20.87 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.99 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  23.13 
 
 		 420 aa  50.4  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  23.2 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  21.38 
 
 		 398 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  25.71 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  22.22 
 
 		 439 aa  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  28.05 
 
 		 427 aa  49.7  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  28.66 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5552  integrase family protein  23.21 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  26.76 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  20.77 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  24.39 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  21.54 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>