191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0745 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3261  phage integrase  81.01 
 
 		 417 aa  691    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0304734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0775  integrase family protein  99.04 
 
 		 418 aa  848    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3610  phage integrase family protein  99.04 
 
 		 418 aa  847    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0772  integrase family protein  99.04 
 
 		 418 aa  850    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.045428  normal  0.308658 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0745  phage integrase family protein  100 
 
 		 418 aa  855    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2028  integrase family protein  66.99 
 
 		 422 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0404622  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3391  integrase family protein  66.75 
 
 		 422 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3363  phage integrase family protein  66.99 
 
 		 422 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.267116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2555  phage integrase family protein  67.22 
 
 		 422 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3487  integrase family protein  66.99 
 
 		 422 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0968357  unclonable  0.00000880604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1978  integrase family protein  66.51 
 
 		 422 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000635719  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3254  phage integrase family protein  66.75 
 
 		 422 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1861  phage integrase family protein  66.99 
 
 		 422 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00488759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1973  phage integrase family protein  66.51 
 
 		 422 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1655  phage integrase family protein  65.71 
 
 		 420 aa  564  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0191595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4354  integrase family protein  37.91 
 
 		 445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0248698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2610  integrase family protein  32.23 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4126  phage integrase family protein  36.36 
 
 		 432 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.727989  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3889  phage integrase, putative  35.16 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000353876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2978  prophage LambdaSo, site-specific recombinase phage integrase family protein  31.17 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1555  phage integrase, putative  32.21 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.206278  decreased coverage  0.0000047649 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0405  phage integrase family protein  28.61 
 
 		 402 aa  159  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.629501  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  26.44 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  26.09 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  26.25 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  23.05 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  25.42 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  24.51 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  25.9 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  27.06 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1878  putative integrase  24.07 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184819 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  24.91 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  24.25 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  24.81 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  24.58 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  28.12 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  28.51 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  25.88 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  28.5 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  26.58 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  25.09 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  24.28 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  25.88 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  27.12 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  26.4 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  21.75 
 
 		 439 aa  57  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  25.1 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  24.51 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  26.09 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  22.07 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  26.39 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  24.12 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  22.67 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  22.07 
 
 		 414 aa  55.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  28.74 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01627  integrase  25.08 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  29.48 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  29.48 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  24.14 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  29.48 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  24.12 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  28.66 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  25.62 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  24.12 
 
 		 376 aa  53.9  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  22.09 
 
 		 414 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  19.87 
 
 		 453 aa  53.5  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1581  hypothetical protein  29.1 
 
 		 168 aa  53.5  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638214  normal  0.178566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  24.22 
 
 		 418 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  24.3 
 
 		 417 aa  53.5  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  23.74 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  26.29 
 
 		 413 aa  53.1  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  23.48 
 
 		 405 aa  53.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  23.08 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  23.67 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  24.31 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  20.8 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  24.39 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.73 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  21.71 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  22.09 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  22.14 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1028  Phage integrase  22.05 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214982  normal  0.0128497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  21.91 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  24.71 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  26.94 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  24.92 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  21.91 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  26.48 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  25.34 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.62 
 
 		 369 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  23.92 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  24.05 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  28.17 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  29.37 
 
 		 391 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  26.47 
 
 		 443 aa  50.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  22.71 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>