More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1273 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1273  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  100 
 
 
190 aa  397  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337645  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  66.32 
 
 
1011 aa  265  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0226  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.3 
 
 
1005 aa  252  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.174026  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1335  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  59.69 
 
 
189 aa  239  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.69 
 
 
1005 aa  231  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0035  formate dehydrogenase  55.9 
 
 
195 aa  230  9e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0057106  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.05 
 
 
1061 aa  229  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.12 
 
 
1008 aa  226  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.89 
 
 
1012 aa  225  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  54.74 
 
 
1014 aa  224  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.36 
 
 
1015 aa  219  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.16 
 
 
1010 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.32 
 
 
1003 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0716  formate dehydrogenase  54.45 
 
 
199 aa  214  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1576  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  54.15 
 
 
200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.91 
 
 
1059 aa  210  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.37 
 
 
1012 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.37 
 
 
1013 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0800  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  44.98 
 
 
232 aa  193  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_176  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase alpha subunit  50.52 
 
 
993 aa  188  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000885934  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0165  formate dehydrogenase alpha subunit  50.52 
 
 
993 aa  187  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.410725  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0187  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.26 
 
 
993 aa  184  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125328  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.21 
 
 
1010 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1113  formate dehydrogenase  47.78 
 
 
204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3512  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.79 
 
 
188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.28 
 
 
1014 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0282  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  43.9 
 
 
202 aa  180  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.84 
 
 
1012 aa  179  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2590  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  43.5 
 
 
196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2268  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  44.1 
 
 
190 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.62 
 
 
1009 aa  175  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  47.21 
 
 
1010 aa  169  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0612  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.81 
 
 
1118 aa  169  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  49.24 
 
 
1010 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.52 
 
 
1020 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.52 
 
 
1020 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2089  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  43.52 
 
 
191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.578931  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3753  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  41.54 
 
 
195 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.97 
 
 
1066 aa  155  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.03 
 
 
1028 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.54 
 
 
1028 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.97 
 
 
1016 aa  154  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1826  formate dehydrogenase alpha subunit  41.21 
 
 
196 aa  153  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0104  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  40.1 
 
 
193 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4383  twin-arginine translocation pathway signal  38.97 
 
 
196 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3983  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.97 
 
 
196 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3545  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.97 
 
 
196 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820445  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2101  molybdopterin oxidoreductase  38.97 
 
 
196 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  40.1 
 
 
1004 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.1 
 
 
1004 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.51 
 
 
1016 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3878  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.97 
 
 
196 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.297199  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3376  formate dehydrogenase  38.97 
 
 
196 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0732  formate dehydrogenase-O, major subunit  37.95 
 
 
196 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4598  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.95 
 
 
196 aa  148  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0420797  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2697  twin-arginine translocation pathway signal  38.38 
 
 
196 aa  147  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00634293 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1690  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  37.95 
 
 
196 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1897  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, major subunit  37.95 
 
 
196 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0687267  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4517  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  36.41 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3491  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  36.92 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2554  formate dehydrogenase-O, major subunit  37.82 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  37.95 
 
 
1023 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  37.95 
 
 
1023 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  38.34 
 
 
1005 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.97 
 
 
1016 aa  145  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3045  formate dehydrogenase, alpha subunit  40 
 
 
1015 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0083  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  36.92 
 
 
195 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0453  molybdopterin oxidoreductase  37.7 
 
 
210 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64299  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0522  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.24 
 
 
196 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0101  twin-arginine translocation pathway signal  39.58 
 
 
193 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0096  twin-arginine translocation pathway signal  39.58 
 
 
193 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5532  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, major subunit  37.37 
 
 
196 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6561  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.31 
 
 
196 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173602  normal  0.0279296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3044  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  39.9 
 
 
191 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0101  selenium-containing formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit  39.58 
 
 
1004 aa  141  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1286  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.97 
 
 
1015 aa  141  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4084  formate dehydrogenase  35.9 
 
 
195 aa  141  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  35.38 
 
 
1016 aa  140  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1683  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  40.2 
 
 
199 aa  140  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.431387 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  35.38 
 
 
1016 aa  140  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.38 
 
 
1016 aa  140  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2055  formate dehydrogenase  37.95 
 
 
195 aa  140  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  35.38 
 
 
1016 aa  140  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  35.38 
 
 
1016 aa  140  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0037  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  35.9 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  37.37 
 
 
1026 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2007  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  34.36 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93426  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1581  formate dehydrogenase  41.2 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.300092  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0860  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.41 
 
 
1039 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  35.9 
 
 
1015 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5829  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  43.75 
 
 
206 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.25228 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  35.9 
 
 
1015 aa  139  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0531  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  36.32 
 
 
196 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.794328  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21850  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  38.73 
 
 
199 aa  138  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0765012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2662  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.95 
 
 
1015 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.613089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1750  formate dehydrogenase alpha subunit  41.12 
 
 
1016 aa  137  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182445 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2174  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  36.92 
 
 
195 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.92 
 
 
1015 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  36.92 
 
 
1015 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0827  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.83 
 
 
1050 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.798346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>