More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0282 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0282  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  100 
 
 
202 aa  421  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1113  formate dehydrogenase  57.84 
 
 
204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1581  formate dehydrogenase  52.78 
 
 
216 aa  225  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.300092  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2590  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  51.26 
 
 
196 aa  205  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.5 
 
 
1011 aa  194  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1335  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  46.23 
 
 
189 aa  186  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.31 
 
 
1010 aa  184  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.39 
 
 
1061 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.85 
 
 
1003 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.65 
 
 
1059 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1576  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  44.65 
 
 
200 aa  181  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0226  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.83 
 
 
1005 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.174026  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1273  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  43.9 
 
 
190 aa  180  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337645  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.05 
 
 
1014 aa  179  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0800  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  43.46 
 
 
232 aa  178  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.03 
 
 
1008 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.85 
 
 
1005 aa  175  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0035  formate dehydrogenase  45.81 
 
 
195 aa  175  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0057106  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.69 
 
 
1010 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  48.54 
 
 
1010 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2268  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  42.38 
 
 
190 aa  169  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.33 
 
 
1015 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0165  formate dehydrogenase alpha subunit  44.66 
 
 
993 aa  168  5e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.410725  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11280  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.5 
 
 
1058 aa  168  5e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.786 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  44.55 
 
 
1014 aa  168  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  47.57 
 
 
1010 aa  167  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.95 
 
 
1013 aa  167  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.5 
 
 
1012 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_176  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase alpha subunit  44.17 
 
 
993 aa  166  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000885934  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3512  formate dehydrogenase, alpha subunit  44 
 
 
188 aa  165  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0187  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.78 
 
 
993 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125328  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.59 
 
 
1012 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.9 
 
 
1009 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21850  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  44.66 
 
 
199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0765012 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0716  formate dehydrogenase  43.72 
 
 
199 aa  161  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.5 
 
 
1012 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1683  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  43.82 
 
 
199 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.431387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3753  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  41.15 
 
 
195 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2007  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  41.15 
 
 
195 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93426  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.15 
 
 
1028 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.15 
 
 
1028 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0612  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.86 
 
 
1118 aa  154  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0860  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.63 
 
 
1039 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3545  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  39.81 
 
 
196 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820445  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4383  twin-arginine translocation pathway signal  39.81 
 
 
196 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3983  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  39.81 
 
 
196 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2101  molybdopterin oxidoreductase  39.81 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2697  twin-arginine translocation pathway signal  39.32 
 
 
196 aa  150  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00634293 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3878  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  40.28 
 
 
196 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.297199  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1700  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  41.35 
 
 
1015 aa  151  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.3444  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3376  formate dehydrogenase  40.28 
 
 
196 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.32 
 
 
1066 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2174  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  40.87 
 
 
195 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207162  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4598  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  39.34 
 
 
196 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0420797  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.78 
 
 
1020 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0083  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  39.52 
 
 
195 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01432  formate dehydrogenase-N, alpha subunit, nitrate-inducible  40.87 
 
 
1015 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.87 
 
 
1015 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  40.87 
 
 
1015 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.29 
 
 
1020 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2089  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  40.29 
 
 
191 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.578931  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04190  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  48.68 
 
 
187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0619785 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0732  formate dehydrogenase-O, major subunit  37.91 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5829  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  44.79 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.25228 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1690  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  37.91 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3491  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  39.81 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1897  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, major subunit  37.91 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0687267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0863  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  44.03 
 
 
195 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125183 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0037  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  39.62 
 
 
195 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2830  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  40.29 
 
 
199 aa  145  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156041  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  37.91 
 
 
1023 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5532  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, major subunit  38.46 
 
 
196 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  39.62 
 
 
1015 aa  144  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4084  formate dehydrogenase  37.8 
 
 
195 aa  144  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2055  formate dehydrogenase  39.32 
 
 
195 aa  144  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  39.62 
 
 
1015 aa  144  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0825  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  43.67 
 
 
195 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2723  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  47.56 
 
 
189 aa  144  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3261  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.91 
 
 
1022 aa  144  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  37.91 
 
 
1023 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  38.46 
 
 
1026 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1750  formate dehydrogenase alpha subunit  41.98 
 
 
1016 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.44 
 
 
1016 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2182  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  47.02 
 
 
189 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.48 
 
 
1016 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  38.94 
 
 
1005 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0876  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.3 
 
 
1096 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.52 
 
 
1016 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0453  molybdopterin oxidoreductase  39.11 
 
 
210 aa  141  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64299  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0104  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.76 
 
 
193 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0872  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.3 
 
 
1096 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  37.74 
 
 
1016 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.74 
 
 
1016 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  37.74 
 
 
1016 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1335  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.19 
 
 
1015 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  37.74 
 
 
1016 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  37.74 
 
 
1016 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3574  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  41.24 
 
 
188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0949477  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.76 
 
 
1004 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0021  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.34 
 
 
1084 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.12847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>