More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1335 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1335  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  100 
 
 
189 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1576  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  58.33 
 
 
200 aa  245  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.31 
 
 
1059 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.82 
 
 
1061 aa  241  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1273  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  59.69 
 
 
190 aa  239  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337645  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0226  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.77 
 
 
1005 aa  234  7e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.174026  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.29 
 
 
1008 aa  230  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.1 
 
 
1005 aa  229  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.02 
 
 
1011 aa  222  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  57.07 
 
 
1014 aa  217  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0716  formate dehydrogenase  54.17 
 
 
199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.83 
 
 
1010 aa  206  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.79 
 
 
1015 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0035  formate dehydrogenase  51.28 
 
 
195 aa  205  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0057106  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.74 
 
 
1012 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.99 
 
 
1014 aa  195  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.51 
 
 
1010 aa  194  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.36 
 
 
1003 aa  194  9e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.44 
 
 
1012 aa  192  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2590  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  46.46 
 
 
196 aa  192  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_176  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase alpha subunit  52.36 
 
 
993 aa  190  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000885934  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0187  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.31 
 
 
993 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125328  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0165  formate dehydrogenase alpha subunit  51.83 
 
 
993 aa  188  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.410725  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.39 
 
 
1013 aa  188  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2268  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  48.97 
 
 
190 aa  187  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0800  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  45.45 
 
 
232 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0282  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  46.23 
 
 
202 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.48 
 
 
1009 aa  184  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  51.53 
 
 
1010 aa  184  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3512  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.44 
 
 
188 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0612  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.69 
 
 
1118 aa  181  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.39 
 
 
1012 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  50 
 
 
1010 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.23 
 
 
1020 aa  175  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2089  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  42.71 
 
 
191 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.578931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.23 
 
 
1020 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1581  formate dehydrogenase  42.99 
 
 
216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.300092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1113  formate dehydrogenase  45.27 
 
 
204 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2697  twin-arginine translocation pathway signal  39.7 
 
 
196 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00634293 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.27 
 
 
1016 aa  168  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2007  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  39.29 
 
 
195 aa  167  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93426  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3044  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  44.27 
 
 
191 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3753  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  40.31 
 
 
195 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.31 
 
 
1028 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.31 
 
 
1028 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3545  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  41.79 
 
 
196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820445  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4383  twin-arginine translocation pathway signal  41.79 
 
 
196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3983  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  41.79 
 
 
196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3878  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  41.79 
 
 
196 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.297199  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4598  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  41.79 
 
 
196 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0420797  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3376  formate dehydrogenase  41.79 
 
 
196 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2101  molybdopterin oxidoreductase  41.29 
 
 
196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0453  molybdopterin oxidoreductase  40 
 
 
210 aa  161  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64299  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.39 
 
 
1066 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1826  formate dehydrogenase alpha subunit  43.43 
 
 
196 aa  160  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1335  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.93 
 
 
1015 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4517  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.76 
 
 
196 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1690  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  41.29 
 
 
196 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1897  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, major subunit  41.29 
 
 
196 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0687267  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  41.29 
 
 
1023 aa  158  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3491  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  40.4 
 
 
196 aa  158  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0732  formate dehydrogenase-O, major subunit  40.8 
 
 
196 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4084  formate dehydrogenase  38.27 
 
 
195 aa  157  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5532  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, major subunit  38.69 
 
 
196 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  41.29 
 
 
1023 aa  157  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.78 
 
 
1016 aa  157  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  38.78 
 
 
1016 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  38.78 
 
 
1016 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  38.78 
 
 
1016 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  38.78 
 
 
1016 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21850  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  39.02 
 
 
199 aa  156  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0765012 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2554  formate dehydrogenase-O, major subunit  37.63 
 
 
214 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3045  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.41 
 
 
1015 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0522  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  39.7 
 
 
196 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  38.69 
 
 
1026 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2662  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.31 
 
 
1015 aa  156  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.613089  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6561  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.63 
 
 
196 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173602  normal  0.0279296 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1819  twin-arginine translocation pathway signal  38.27 
 
 
195 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0037  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.27 
 
 
195 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0083  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.27 
 
 
195 aa  154  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1286  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.4 
 
 
1015 aa  154  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0531  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  39.2 
 
 
196 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.794328  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  38.27 
 
 
1015 aa  153  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  38.27 
 
 
1015 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.31 
 
 
1016 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2055  formate dehydrogenase  37.24 
 
 
195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1683  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  41.21 
 
 
199 aa  152  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.431387 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.8 
 
 
1016 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2830  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.38 
 
 
199 aa  150  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156041  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1700  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  37.76 
 
 
1015 aa  150  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.3444  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2174  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.24 
 
 
195 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207162  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11280  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.75 
 
 
1058 aa  150  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0543  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.69 
 
 
196 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0816822 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01432  formate dehydrogenase-N, alpha subunit, nitrate-inducible  37.24 
 
 
1015 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.24 
 
 
1015 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  37.24 
 
 
1015 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3261  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.11 
 
 
1022 aa  148  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04190  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  47.2 
 
 
187 aa  148  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0619785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0343  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  48.59 
 
 
186 aa  148  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.434466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0863  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  39.47 
 
 
195 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>