More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0716 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0716  formate dehydrogenase  100 
 
 
199 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  72.25 
 
 
1005 aa  301  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  70.16 
 
 
1008 aa  292  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0226  formate dehydrogenase, alpha subunit  67.02 
 
 
1005 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.174026  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  69.63 
 
 
1014 aa  276  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.92 
 
 
1011 aa  254  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.16 
 
 
1010 aa  227  8e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1273  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  54.45 
 
 
190 aa  224  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337645  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1335  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  54.17 
 
 
189 aa  223  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1576  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  53.88 
 
 
200 aa  218  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.43 
 
 
1061 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.88 
 
 
1059 aa  214  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.16 
 
 
1003 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.08 
 
 
1012 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0035  formate dehydrogenase  47.45 
 
 
195 aa  193  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0057106  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2268  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  46.94 
 
 
190 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.45 
 
 
1009 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.43 
 
 
1015 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.97 
 
 
1010 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.27 
 
 
1014 aa  181  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3512  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.98 
 
 
188 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.93 
 
 
1013 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0800  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  41.63 
 
 
232 aa  176  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.41 
 
 
1012 aa  174  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  46.46 
 
 
1010 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2089  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  45.92 
 
 
191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.578931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.94 
 
 
1020 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  47.47 
 
 
1010 aa  171  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.43 
 
 
1020 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_176  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase alpha subunit  43.39 
 
 
993 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000885934  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0165  formate dehydrogenase alpha subunit  43.16 
 
 
993 aa  169  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.410725  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0282  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  44.88 
 
 
202 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0187  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.68 
 
 
993 aa  168  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1113  formate dehydrogenase  43.6 
 
 
204 aa  168  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2590  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  40.8 
 
 
196 aa  168  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.84 
 
 
1012 aa  168  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.662776 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2174  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  41.92 
 
 
195 aa  158  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0037  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  41.03 
 
 
195 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3044  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  44.33 
 
 
191 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  41.03 
 
 
1016 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.03 
 
 
1016 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  41.03 
 
 
1016 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0083  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  41.03 
 
 
195 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  41.03 
 
 
1016 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  41.03 
 
 
1016 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01432  formate dehydrogenase-N, alpha subunit, nitrate-inducible  41.92 
 
 
1015 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  41.03 
 
 
1015 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.97 
 
 
1066 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0612  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.05 
 
 
1118 aa  156  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.92 
 
 
1015 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4084  formate dehydrogenase  41.12 
 
 
195 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  41.03 
 
 
1015 aa  156  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  41.92 
 
 
1015 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.54 
 
 
1016 aa  155  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.05 
 
 
1016 aa  155  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2055  formate dehydrogenase  41.03 
 
 
195 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3753  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  38.97 
 
 
195 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1700  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  41.41 
 
 
1015 aa  155  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.3444  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.97 
 
 
1028 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0453  molybdopterin oxidoreductase  42.19 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64299  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.97 
 
 
1028 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3545  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.27 
 
 
196 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820445  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4383  twin-arginine translocation pathway signal  38.27 
 
 
196 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3983  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.27 
 
 
196 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2101  molybdopterin oxidoreductase  38.27 
 
 
196 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2007  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.95 
 
 
195 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93426  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2662  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.56 
 
 
1015 aa  151  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.613089  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1581  formate dehydrogenase  40.18 
 
 
216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.300092  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1826  formate dehydrogenase alpha subunit  41 
 
 
196 aa  149  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.33 
 
 
1016 aa  148  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4598  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.76 
 
 
196 aa  147  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0420797  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3491  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.24 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1286  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.03 
 
 
1015 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3878  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.76 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.297199  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4517  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.24 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3376  formate dehydrogenase  37.76 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1335  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.51 
 
 
1015 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0732  formate dehydrogenase-O, major subunit  36.73 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  37.24 
 
 
1023 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2554  formate dehydrogenase-O, major subunit  36.22 
 
 
214 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1897  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, major subunit  36.22 
 
 
196 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0687267  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6561  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38 
 
 
196 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173602  normal  0.0279296 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1690  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  36.22 
 
 
196 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  36.22 
 
 
1023 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3045  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.49 
 
 
1015 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3261  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.36 
 
 
1022 aa  141  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1750  formate dehydrogenase alpha subunit  40.31 
 
 
1016 aa  141  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182445 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21850  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  40.87 
 
 
199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0765012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0104  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.5 
 
 
193 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0437  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.54 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  35.75 
 
 
1005 aa  138  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.5 
 
 
1004 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.5 
 
 
1004 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03810  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.38 
 
 
1018 aa  134  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11280  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.94 
 
 
1058 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.786 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0101  twin-arginine translocation pathway signal  36.98 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0096  twin-arginine translocation pathway signal  36.98 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0101  selenium-containing formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit  36.98 
 
 
1004 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5532  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, major subunit  34.18 
 
 
196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1093  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.65 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>