More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2452 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2452  aminotransferase class I and II  100 
 
 
386 aa  765    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2329  aminotransferase, class I and II  87.56 
 
 
386 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.202877  decreased coverage  0.00110828 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6548  aminotransferase class I and II  57.77 
 
 
396 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3787  aminotransferase  46.34 
 
 
390 aa  333  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5598  aminotransferase class I and II  41.6 
 
 
385 aa  274  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  33.61 
 
 
393 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  32.77 
 
 
393 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  30.79 
 
 
391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  31.44 
 
 
384 aa  152  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  32.15 
 
 
389 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  33.24 
 
 
391 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  31.78 
 
 
396 aa  149  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  29.6 
 
 
397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 
387 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  35.53 
 
 
413 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  25.58 
 
 
399 aa  144  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  24.8 
 
 
401 aa  143  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  30.46 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  26.93 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  32.14 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  33.15 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  33.15 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  31.18 
 
 
393 aa  140  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  29.97 
 
 
392 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  25.26 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  31.4 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  33.87 
 
 
384 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  31.67 
 
 
393 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  29.21 
 
 
388 aa  136  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  28.72 
 
 
412 aa  136  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  35.78 
 
 
400 aa  136  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  31.03 
 
 
397 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  27.22 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  28.76 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  31.94 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  29.2 
 
 
386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  32.42 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  27.98 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  31.64 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  30.95 
 
 
400 aa  133  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  32.08 
 
 
386 aa  133  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  30.09 
 
 
444 aa  133  6.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  30.75 
 
 
396 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  35.09 
 
 
390 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  35.09 
 
 
390 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  30.36 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  30.84 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  32.43 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  30.34 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  29.63 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  33.77 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  28.9 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  35 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  33.56 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  24.62 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  30.81 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  26.25 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  32.53 
 
 
384 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  33.77 
 
 
390 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  34.55 
 
 
390 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  29.88 
 
 
390 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  29.04 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  33.01 
 
 
383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  29.56 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  30.55 
 
 
384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  25.26 
 
 
391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  30.55 
 
 
384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  30.55 
 
 
385 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  31 
 
 
384 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  29.04 
 
 
399 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  29.71 
 
 
383 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  32.85 
 
 
397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  29.56 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  29.56 
 
 
391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  29.56 
 
 
391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  29.56 
 
 
391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  29.56 
 
 
391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  29.56 
 
 
391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  32.13 
 
 
413 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  33.33 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  34.08 
 
 
384 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  33.13 
 
 
409 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  32.58 
 
 
409 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1353  aspartate aminotransferase  29.75 
 
 
385 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  31.83 
 
 
394 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  29.25 
 
 
379 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  27.99 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  28.1 
 
 
389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  30.53 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  27.41 
 
 
411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  27.22 
 
 
393 aa  126  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  30.33 
 
 
409 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  26.87 
 
 
410 aa  126  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  26.67 
 
 
389 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  29.66 
 
 
392 aa  126  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  30.63 
 
 
394 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  33.52 
 
 
381 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  31.95 
 
 
402 aa  125  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  28.69 
 
 
395 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  26.32 
 
 
398 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>