More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2329 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2329  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 386 aa  768    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.202877  decreased coverage  0.00110828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2452  aminotransferase class I and II  87.56 
 
 		 386 aa  620  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6548  aminotransferase class I and II  56.74 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3787  aminotransferase  47.64 
 
 		 390 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5598  aminotransferase class I and II  41.39 
 
 		 385 aa  272  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  33.9 
 
 		 393 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  32.87 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  31.84 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  35.42 
 
 		 391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  32.59 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  31.91 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  30.65 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  26.74 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  31.52 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  26.28 
 
 		 386 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  31.81 
 
 		 396 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  32.87 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  32.87 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  30.81 
 
 		 384 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  31.87 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  27.94 
 
 		 387 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  28.96 
 
 		 397 aa  142  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  26.47 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  32.33 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  30.38 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  27.97 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  33.44 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  28.49 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  32.97 
 
 		 393 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  25.45 
 
 		 399 aa  139  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  34.77 
 
 		 400 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  32.8 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  31.02 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  30.62 
 
 		 386 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  28.94 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  25.62 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  30.65 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  28.31 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  35.42 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  32.06 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  30.03 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  28.79 
 
 		 412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  29.67 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  32.94 
 
 		 397 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  27.84 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  31.9 
 
 		 387 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  29.59 
 
 		 394 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  27.91 
 
 		 400 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  28.33 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  32.39 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  27.08 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  31.98 
 
 		 397 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  30.11 
 
 		 400 aa  131  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  28.02 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  34.09 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  33.94 
 
 		 397 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  28.01 
 
 		 410 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  26.67 
 
 		 397 aa  129  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  28.88 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  30.68 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  32.33 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  28.94 
 
 		 402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  31.95 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  33.65 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  28.14 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  34.05 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  32.46 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  33.18 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  28.37 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  33.33 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  33.33 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0102  aminotransferase, class I and II  34.75 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.848816  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  33.64 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  28.46 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06061  putative aminotransferase  29.84 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0129479  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  31.95 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  31.95 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  31.95 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  31.95 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00866  putative aminotransferase  29.84 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.387551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  31.95 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  31.95 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  34.64 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  31.95 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  31.83 
 
 		 387 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  27.68 
 
 		 387 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  29.22 
 
 		 383 aa  126  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  26.01 
 
 		 398 aa  126  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  30.67 
 
 		 400 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  29.06 
 
 		 400 aa  126  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  33.79 
 
 		 413 aa  126  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  27.09 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  25.32 
 
 		 389 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  28.53 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0014  putative aminotransferase  28.41 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  32.27 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  30.5 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  32.12 
 
 		 409 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  25.86 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  32.85 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>