More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3787 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3787  aminotransferase  100 
 
 
390 aa  770    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6548  aminotransferase class I and II  53.3 
 
 
396 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5598  aminotransferase class I and II  44.36 
 
 
385 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2452  aminotransferase class I and II  45.83 
 
 
386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2329  aminotransferase, class I and II  47.22 
 
 
386 aa  298  9e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.202877  decreased coverage  0.00110828 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  32 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  30.39 
 
 
389 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  31.55 
 
 
388 aa  169  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  29.61 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  30.45 
 
 
390 aa  167  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  32.84 
 
 
409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  32.84 
 
 
402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  29.61 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  29.61 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  29.31 
 
 
398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  28.39 
 
 
396 aa  163  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  29.67 
 
 
401 aa  162  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  32.09 
 
 
387 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  28.91 
 
 
398 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  33.85 
 
 
393 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  31.76 
 
 
401 aa  160  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  28.91 
 
 
398 aa  160  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  29.38 
 
 
395 aa  159  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.46 
 
 
385 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  29.61 
 
 
388 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  28.96 
 
 
388 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  28.38 
 
 
397 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  31.96 
 
 
389 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  29.38 
 
 
386 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  28.09 
 
 
395 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  28.09 
 
 
395 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  28.09 
 
 
395 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  28.09 
 
 
395 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  33.13 
 
 
399 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  28.09 
 
 
395 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  31.41 
 
 
384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  28.7 
 
 
396 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  28.7 
 
 
396 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  27.39 
 
 
390 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  27.68 
 
 
396 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  27.68 
 
 
396 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  27.68 
 
 
396 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  27.68 
 
 
396 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  28.7 
 
 
396 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  27.68 
 
 
396 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  32.3 
 
 
398 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  30.48 
 
 
396 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  26.63 
 
 
395 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  27.78 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  33.44 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  32.08 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  27.78 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  28.4 
 
 
396 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  33.45 
 
 
391 aa  153  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  31.53 
 
 
391 aa  153  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1353  aspartate aminotransferase  30.03 
 
 
385 aa  154  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  33.97 
 
 
409 aa  153  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  31.15 
 
 
386 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  28.17 
 
 
386 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  30.42 
 
 
400 aa  152  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  27.47 
 
 
395 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  29.9 
 
 
391 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  29.64 
 
 
385 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  27.16 
 
 
395 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  28.12 
 
 
393 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  27.43 
 
 
397 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  29.67 
 
 
405 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  27.16 
 
 
395 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  27.95 
 
 
396 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 
413 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  27.82 
 
 
390 aa  151  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  28.3 
 
 
400 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  30.79 
 
 
410 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  30.3 
 
 
410 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  28.61 
 
 
396 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  28.91 
 
 
400 aa  149  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  32.91 
 
 
400 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  27.52 
 
 
389 aa  149  8e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  29.41 
 
 
412 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  30.16 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  27.64 
 
 
388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  32 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  29.05 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  32.42 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  28.48 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  30.28 
 
 
392 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  33.54 
 
 
413 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  28.96 
 
 
380 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  29.75 
 
 
379 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  31.79 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  28.5 
 
 
387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  27.6 
 
 
387 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  31.1 
 
 
400 aa  147  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  27.6 
 
 
387 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  27.85 
 
 
400 aa  146  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  30.77 
 
 
400 aa  146  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  30.77 
 
 
400 aa  146  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  30.99 
 
 
400 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  30.7 
 
 
396 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  32.9 
 
 
392 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.241415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>