More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6548 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6548  aminotransferase class I and II  100 
 
 
396 aa  796    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2452  aminotransferase class I and II  57.51 
 
 
386 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2329  aminotransferase, class I and II  56.48 
 
 
386 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.202877  decreased coverage  0.00110828 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3787  aminotransferase  53.3 
 
 
390 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5598  aminotransferase class I and II  45.03 
 
 
385 aa  297  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  32.48 
 
 
392 aa  172  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  33.15 
 
 
393 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  32.2 
 
 
393 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  32.02 
 
 
409 aa  169  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  31.99 
 
 
409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  30.96 
 
 
389 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  29.54 
 
 
386 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  32.48 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  33.43 
 
 
397 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  30 
 
 
388 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  30 
 
 
388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 
384 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  30.06 
 
 
397 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  31.3 
 
 
395 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  32.5 
 
 
402 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  28.18 
 
 
386 aa  159  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  28.57 
 
 
392 aa  159  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  29.53 
 
 
386 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  32.33 
 
 
388 aa  159  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  32.48 
 
 
386 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  27.25 
 
 
401 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  25.84 
 
 
399 aa  158  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  32.35 
 
 
398 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  30.42 
 
 
392 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  30.08 
 
 
394 aa  157  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  27.51 
 
 
401 aa  157  4e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  27.52 
 
 
389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  30.56 
 
 
400 aa  155  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  29.17 
 
 
387 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  27.65 
 
 
375 aa  155  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  28.7 
 
 
395 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  33.14 
 
 
401 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  30 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1558  aminotransferase class I and II  30.66 
 
 
386 aa  153  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0317788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  31.44 
 
 
400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  31.25 
 
 
390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  31.68 
 
 
387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  27.95 
 
 
390 aa  153  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  30.47 
 
 
444 aa  152  8e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  29.76 
 
 
379 aa  152  8e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  36.76 
 
 
391 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  32.15 
 
 
413 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  31.28 
 
 
409 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  29.63 
 
 
398 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  31.3 
 
 
390 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  29.6 
 
 
393 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2698  putative aminotransferase  31.42 
 
 
382 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1578  aspartate aminotransferase  28.14 
 
 
387 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.776902  hitchhiker  0.00064422 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  29.6 
 
 
401 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  30.23 
 
 
396 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  37.1 
 
 
413 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  33.33 
 
 
397 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  26.22 
 
 
397 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  35.63 
 
 
397 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  28.05 
 
 
387 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  28.96 
 
 
391 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  29.01 
 
 
398 aa  150  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  29.81 
 
 
388 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  32.12 
 
 
387 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  28.57 
 
 
400 aa  149  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  30.53 
 
 
389 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  34.11 
 
 
421 aa  149  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  34.37 
 
 
402 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  26.45 
 
 
399 aa  149  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  27.86 
 
 
390 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  30.06 
 
 
390 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  29.62 
 
 
396 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  29.35 
 
 
396 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  32.97 
 
 
385 aa  149  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  30.03 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  31.01 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  30.39 
 
 
393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  27.71 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  26.4 
 
 
398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  30.98 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  31 
 
 
400 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  26.33 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  30.33 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  31.03 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  31.68 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  30.25 
 
 
390 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  30.98 
 
 
390 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  30.98 
 
 
390 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0102  aminotransferase, class I and II  32.26 
 
 
401 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.848816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  29.59 
 
 
388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  26.65 
 
 
398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  31.01 
 
 
409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  30.68 
 
 
391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  31.55 
 
 
394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  30.28 
 
 
396 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  29.94 
 
 
387 aa  146  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  30.41 
 
 
391 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  30.41 
 
 
384 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  30.41 
 
 
391 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  30.41 
 
 
391 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>