118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2426 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2426  LrgA  100 
 
 		 138 aa  266  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  48 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  47.66 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  50.86 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  46.28 
 
 		 119 aa  87  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  39.68 
 
 		 133 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  42.15 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  43.9 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  41.12 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  42.34 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  39.83 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  41.94 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  41.94 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  38.52 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  41.18 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  40.98 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3929  LrgA family protein  44.25 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.319977 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3004  LrgA family protein  45.08 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  41.59 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  41.38 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  44.34 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  38.33 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  43.16 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  36.13 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  39.32 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  40.83 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  38.98 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3577  putative integral membrane protein  48.04 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  32.77 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  38.84 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  31.63 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  38.71 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2210  LrgA family protein  39.17 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.522821  normal  0.122076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0332  LrgA  38.46 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  38.52 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  50 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  37.19 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2739  LrgA family protein  48.33 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0493  LrgA  36.07 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0665  LrgA family protein  43.12 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  28.81 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0887  LrgA family protein  40.74 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  31.15 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  34.62 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  29.59 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3734  LrgA family protein  47.06 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  34.55 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  31.67 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  34.31 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  32.43 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  33.03 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0706  LrgA family protein  36.14 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156699  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  33.03 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  33.03 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7637  LrgA  37.9 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2976  LrgA family protein  34.67 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.952939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  31.53 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0155  putative LrgA family protein  37.31 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5344  LrgA family protein  38.21 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2404  LrgA family protein  34.67 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  36.04 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  33.88 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28750  putative effector of murein hydrolase LrgA  38.98 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0545  LrgA family protein  40.86 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  37.9 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  37.9 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  31.53 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  33.01 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1099  hypothetical protein  37.7 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  35.21 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  29.57 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0624  LrgA  38.14 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.938941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  33.67 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0073  LrgA family protein  31.33 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6616  LrgA family protein  40.38 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  35.21 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  35.21 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  30.63 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0447  LrgA  34.07 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  30.58 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1325  LrgA family protein  36.36 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  33.8 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  33.8 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  33.8 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  33.8 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  33.8 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  32.8 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  32.39 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  33.8 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  33.8 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  25.21 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3333  hypothetical protein  44.3 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  27.94 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0421  LrgA family protein  35.59 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.712638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  35.19 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3294  LrgA  35.14 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0247  murein hydrolase regulator LrgA  29.73 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  28.57 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0253  murein hydrolase regulator LrgA  29.73 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  32.08 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>