142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1009 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  100 
 
 
118 aa  216  7.999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  39.8 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  35.19 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  34.55 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  33.64 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  33.64 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  34.26 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  34.26 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  36.28 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  34.26 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  34.26 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  34.26 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  34.26 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  34.26 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  40.24 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  38.53 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  37.23 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  38.64 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  36.17 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  33.06 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  36.36 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  35.04 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  28.04 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  32.04 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  32.04 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  30.36 
 
 
128 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  28.57 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  29.46 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0899  LrgA  30.19 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  28.21 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  26.36 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0247  murein hydrolase regulator LrgA  28.04 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0253  murein hydrolase regulator LrgA  28.04 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  26.53 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  31.3 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  29 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2026  murein hydrolase regulator LrgA  32.26 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  30.93 
 
 
163 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2764  LrgA family protein  31.86 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  29.82 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  33.7 
 
 
248 aa  54.3  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  28.95 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  32.47 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  34.65 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0197927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  29 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  29 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1606  LrgA  38.46 
 
 
186 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  29 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  29 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  28.32 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  29 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  29 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  30.16 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  28 
 
 
132 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  28 
 
 
132 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0090  LrgA family protein  31.52 
 
 
138 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  36.63 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0100  LrgA family protein  31.52 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  28 
 
 
132 aa  51.2  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  28.83 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1681  inner membrane protein, LrgA family  29.87 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003697  antiholin-like protein LrgA  30 
 
 
124 aa  50.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  29.31 
 
 
119 aa  50.1  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  32.35 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  31 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  33.04 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0854  hypothetical protein  26.47 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  26.09 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3795  LrgA family protein  31.82 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  28.92 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  28.92 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  31.08 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0244  LrgA family protein  26.37 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  28.92 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  28.92 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  28.92 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1950  LrgA family protein  28.57 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000107186  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3227  LrgA  37.7 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0027  LrgA  38.33 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  38.33 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0073  LrgA family protein  30.95 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0043  LrgA family protein  38.33 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0062  LrgA family protein  38.33 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  32.32 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0044  LrgA family protein  38.33 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8296  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  36.51 
 
 
128 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  33.66 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  30.77 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  28.26 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0046  LrgA family protein  37.7 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2564  LrgA family protein  30.77 
 
 
131 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2617  LrgA family protein  30.77 
 
 
131 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  23.89 
 
 
135 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  23.89 
 
 
135 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  23.89 
 
 
135 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  29.03 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  27.59 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  28.83 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  23.85 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>