131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3025 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  63.7 
 
 		 135 aa  189  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  65.19 
 
 		 135 aa  185  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  63.7 
 
 		 135 aa  181  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  63.7 
 
 		 136 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  64.44 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  65.15 
 
 		 132 aa  174  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  65.15 
 
 		 132 aa  174  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.502581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  64.39 
 
 		 132 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  64.39 
 
 		 132 aa  174  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  64.39 
 
 		 132 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  64.39 
 
 		 132 aa  174  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  64.39 
 
 		 132 aa  174  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  64.39 
 
 		 132 aa  174  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  69.05 
 
 		 132 aa  173  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  63.64 
 
 		 132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  67.46 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  67.46 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  67.46 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  67.46 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  67.46 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  57.04 
 
 		 138 aa  154  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2764  LrgA family protein  53.33 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0854  hypothetical protein  46.49 
 
 		 129 aa  93.6  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  37.39 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  38.6 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003697  antiholin-like protein LrgA  44.83 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1681  inner membrane protein, LrgA family  41.46 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  36.63 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  34.65 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  31.03 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  32.38 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  34.21 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  31.73 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  30.33 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  35.56 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  28.95 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  31.09 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  33.33 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  34.23 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  28.45 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  28.16 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  31.19 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  34.09 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  34.09 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  29.46 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  34.09 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0706  LrgA family protein  40.54 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  26.96 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  33.93 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  26.96 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  26.79 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  26.96 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3525  holin-like protein  30.84 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  26.96 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  26.96 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  29.52 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  26.09 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  26.09 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  26.09 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0073  LrgA family protein  37.8 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  26.09 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  27.62 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  35.87 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  32.28 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  34.09 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  30.83 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  32.04 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1346  LrgA family protein  38.75 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.749748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  34.67 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  25.22 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1230  LrgA family protein  33.63 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  27.52 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0100  LrgA family protein  31.4 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0090  LrgA family protein  31.4 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  28.87 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2908  LrgA family protein  37.11 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  28.07 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  28.95 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  32.98 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  26.5 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  32.98 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  29.82 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2117  LrgA family protein  29.91 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00374978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  32.74 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  31.19 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  23.89 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  25.86 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1950  LrgA family protein  28.83 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000107186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  33.01 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5535  murein hydrolase regulator LrgA  29.9 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  32.22 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5233  murein hydrolase regulator LrgA  26.45 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  29.51 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  37.7 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  30.7 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1483  putative effector of murein hydrolase LrgA  33.33 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000434709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2210  LrgA family protein  25 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.522821  normal  0.122076 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>