119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1066 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  100 
 
 		 136 aa  258  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  37.39 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  36.89 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  36.52 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  36.36 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  37.39 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  37.39 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  37.39 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  35.65 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  40.37 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  35.2 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  35.2 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  33.93 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  35.2 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  35.2 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  35.2 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  35.2 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  35.2 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  35.2 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  35.2 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003697  antiholin-like protein LrgA  36.63 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  36.63 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2764  LrgA family protein  35.71 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0854  hypothetical protein  37.39 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  37.74 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  37.74 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  37.74 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  37.74 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  37.74 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  39.81 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  37.25 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0247  murein hydrolase regulator LrgA  33.61 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0253  murein hydrolase regulator LrgA  33.61 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5233  murein hydrolase regulator LrgA  38.61 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  36.45 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5294  murein hydrolase regulator LrgA  36.63 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5121  murein hydrolase regulator LrgA  36.63 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5136  murein hydrolase regulator LrgA  36.63 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  35.14 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5690  murein hydrolase regulator LrgA  36.63 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5620  murein hydrolase regulator LrgA  37.86 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5564  murein hydrolase regulator LrgA  36.63 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5385  murein hydrolase regulator LrgA  36.63 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.655957 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5572  murein hydrolase regulator LrgA  36.63 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  32.41 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  36.36 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  38.96 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  34.51 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5535  murein hydrolase regulator LrgA  35.64 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3957  murein hydrolase regulator LrgA  38.54 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  36.11 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  32.97 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  32.71 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  33.64 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0706  LrgA family protein  31.78 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156699  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1681  inner membrane protein, LrgA family  37.68 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2026  murein hydrolase regulator LrgA  37.66 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  29.73 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  31.43 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  30.63 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  34.91 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  29.73 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  29.29 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  35.48 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  33.01 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  38.81 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  31.53 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0073  LrgA family protein  33.03 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  35.05 
 
 		 129 aa  50.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  35.05 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  30.63 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  30.63 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  27.19 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  30.63 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  30.63 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  30.63 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  30.63 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  30.63 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  29.81 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  29.59 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  30.63 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  30.63 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1346  LrgA family protein  28.72 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.749748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  29.73 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  41.67 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  25.44 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  29.29 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  27.08 
 
 		 248 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0184  hypothetical protein  35.38 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2426  LrgA  38.89 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1230  LrgA family protein  30.3 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0292  LrgA family protein  37.66 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  29.46 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  29.25 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1483  putative effector of murein hydrolase LrgA  38.46 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000434709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5236  holin-like protein  31.73 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  26 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  26 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5741  LrgA family protein  31.73 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5705  holin-like protein  31.73 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0190593  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>