148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3282 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  100 
 
 		 124 aa  241  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  73.98 
 
 		 124 aa  183  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  49.59 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  50 
 
 		 113 aa  96.7  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  51.85 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  47.5 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  43.55 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  47.58 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  45.9 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  43.59 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  42.42 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  42.15 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  49.51 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  45.13 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3004  LrgA family protein  47.27 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  37.12 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  37.29 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  35.94 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  39.82 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  35.94 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  38.66 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  40.94 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2426  LrgA  42.5 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  38.33 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  40.65 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  35.14 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  34.78 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  38.76 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3929  LrgA family protein  35.96 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.319977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  37.8 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  33.61 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  32.5 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  33.61 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  42.28 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  36.13 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0493  LrgA  36 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0332  LrgA  36.67 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  35.05 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0292  LrgA family protein  41.59 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0887  LrgA family protein  48.28 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  37 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  35.9 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3577  putative integral membrane protein  41.51 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  32.99 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  34.09 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  32.48 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0665  LrgA family protein  38.53 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810198  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  29.29 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  35.79 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  35.79 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  35.79 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  39.84 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  29.84 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  42.16 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  42.16 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  30.89 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  30.89 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  30.08 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  30.08 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  30.08 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  30.08 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  30.08 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  30.08 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7637  LrgA  42.16 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  34.34 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6616  LrgA family protein  42.16 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112454 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3734  LrgA family protein  51.46 
 
 		 169 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  28.26 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0247  murein hydrolase regulator LrgA  30.93 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0253  murein hydrolase regulator LrgA  30.93 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  32.32 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3525  holin-like protein  34.74 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  29.27 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  30.51 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  30 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  32.63 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  30.43 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0624  LrgA  35.77 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.938941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1325  LrgA family protein  37.61 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1230  LrgA family protein  35.05 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0184  hypothetical protein  29.55 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1099  hypothetical protein  34.09 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2908  LrgA family protein  35.82 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1095  hypothetical protein  36.97 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00291495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  31.68 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  31.68 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  31.68 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  32.71 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  31.68 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  31.68 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>