132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1325 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1325  LrgA family protein  100 
 
 		 121 aa  226  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  62.81 
 
 		 123 aa  133  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0292  LrgA family protein  56 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0605  LrgA  60.87 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  46.55 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  41.32 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  43.64 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  48.54 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  41.8 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  43.93 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  37.19 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  40.83 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3004  LrgA family protein  41.54 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149466 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  33.61 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3577  putative integral membrane protein  44.83 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  39.32 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  37.38 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  36.36 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  40.16 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  42.11 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  42.73 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  39.42 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  39.42 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  40.18 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  29.91 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  38.46 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  38.46 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  37.5 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  38.46 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  38.46 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  38.46 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  35.96 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  42.2 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  38.46 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  37.5 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  37.5 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  32.11 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  34.04 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  36.21 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  38.52 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  43.64 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5344  LrgA family protein  38.84 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  29.51 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  29.51 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  42.73 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  42.31 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  42.31 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  41.23 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  42.73 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  42.45 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  38.18 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6616  LrgA family protein  41.35 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0636  LrgA  36.52 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7637  LrgA  41.35 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7209  hypothetical protein  33.91 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0332  LrgA  41.88 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  37.5 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0155  putative LrgA family protein  48.05 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0624  LrgA  44.62 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.938941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0887  LrgA family protein  45.79 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  29.6 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0735  LrgA family protein  37.39 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233913  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  29.01 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  37.17 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3734  LrgA family protein  45.13 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  34.91 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0493  LrgA  40.16 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3957  murein hydrolase regulator LrgA  36.56 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  36.7 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5572  murein hydrolase regulator LrgA  35.87 
 
 		 170 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  37.5 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5620  murein hydrolase regulator LrgA  35.87 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  31.78 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5294  murein hydrolase regulator LrgA  35.87 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5121  murein hydrolase regulator LrgA  35.87 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5136  murein hydrolase regulator LrgA  35.87 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5385  murein hydrolase regulator LrgA  35.87 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.655957 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5564  murein hydrolase regulator LrgA  35.87 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5690  murein hydrolase regulator LrgA  35.87 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  31.78 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  30.77 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5535  murein hydrolase regulator LrgA  34.78 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5233  murein hydrolase regulator LrgA  34.78 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1483  putative effector of murein hydrolase LrgA  38.64 
 
 		 124 aa  50.1  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000434709  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  30.16 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  27.42 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  27.42 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  27.42 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1681  inner membrane protein, LrgA family  28.28 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1230  LrgA family protein  30.59 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2426  LrgA  36.75 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1953  LrgA family protein  34.51 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.849532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  37.78 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  34.31 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3929  LrgA family protein  33.65 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.319977 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  49.25 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0854  hypothetical protein  30.63 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0665  LrgA family protein  37.93 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810198  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  30.21 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2234  LrgA family protein  41.38 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>