122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3577 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3577  putative integral membrane protein  100 
 
 		 125 aa  238  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  44.54 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  42.45 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  46.23 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  43.1 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  43.75 
 
 		 125 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  40.34 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  42.97 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  45.45 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  34.71 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  44.17 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  41.44 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  48.11 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  41.12 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  43.48 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  41.51 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  43.48 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  39.09 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  36.29 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  40.52 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  40.34 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  43.36 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1160  LrgA family protein  46.09 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  41.03 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1095  hypothetical protein  39.02 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00291495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  36.8 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3929  LrgA family protein  43.56 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.319977 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7637  LrgA  46.73 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2426  LrgA  48.04 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  39.39 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  47.17 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  47.17 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  36.36 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  38.38 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  38.38 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6616  LrgA family protein  46.23 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112454 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  48.11 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  38.38 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  38.38 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  38.38 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  37.37 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  38.38 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  37.37 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  37.37 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  37.37 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0887  LrgA family protein  42.86 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  36.36 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5344  LrgA family protein  40.8 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  48.11 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0665  LrgA family protein  45.05 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810198  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3004  LrgA family protein  40.91 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  37 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  41.51 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3734  LrgA family protein  46.77 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  34.68 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0332  LrgA  41.8 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  48.65 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  46.34 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  30.84 
 
 		 248 aa  54.3  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11920  hypothetical protein  37.19 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00345177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0735  LrgA family protein  34.71 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233913  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0636  LrgA  34.15 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  31.18 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1325  LrgA family protein  42.45 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0292  LrgA family protein  40.65 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  35.42 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  32.03 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2210  LrgA family protein  42.5 
 
 		 125 aa  50.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.522821  normal  0.122076 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  33.65 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  37.14 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0545  LrgA family protein  39.22 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  33.33 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  33.96 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0447  LrgA  31.97 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  31.37 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  31.37 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  31.37 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2739  LrgA family protein  40.5 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  31.37 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  34.51 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0155  putative LrgA family protein  44.62 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  31.37 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3294  LrgA  32.86 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  34.51 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  31.37 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  29.57 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  32.26 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08300  integral membrane protein, LrgA family  44.3 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0814832  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0073  LrgA family protein  34.18 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3525  holin-like protein  31.37 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2404  LrgA family protein  42.42 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2976  LrgA family protein  42.42 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.952939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  31.18 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  29.58 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  30.36 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  30.36 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  30.36 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1261  hypothetical protein  51.16 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3795  LrgA family protein  33.33 
 
 		 135 aa  42.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0605  LrgA  40 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>