55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2234 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2234  LrgA family protein  100 
 
 		 152 aa  280  6.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4094  LrgA  68.91 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  36.28 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  32.74 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28750  putative effector of murein hydrolase LrgA  55.36 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  37.17 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  34.78 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  38.02 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  36.28 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  31.58 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  36.28 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  36.19 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  35.71 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  30.19 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  35.09 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  32.14 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  39.66 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  32.41 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  32.41 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  32.41 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  32.41 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  32.41 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  28.83 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  32.41 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  32.41 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  30.56 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  31.48 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  31.46 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  31.48 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  31.73 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  31.03 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  31.13 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  34.21 
 
 		 123 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  26.5 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  25.69 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  35.09 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  39.19 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  34.04 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2426  LrgA  34.48 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  31.4 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0854  hypothetical protein  27.17 
 
 		 129 aa  43.9  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  27.47 
 
 		 125 aa  43.9  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  34.21 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  27.47 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  36.54 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  48.53 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0073  LrgA family protein  34.78 
 
 		 114 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5344  LrgA family protein  35.09 
 
 		 123 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  31.78 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  23 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  25.84 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  31.78 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  29.57 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3734  LrgA family protein  35.56 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>