67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4094 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4094  LrgA  100 
 
 		 132 aa  241  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2234  LrgA family protein  68.91 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  41.28 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  42.24 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  39.45 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28750  putative effector of murein hydrolase LrgA  60.38 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  36.04 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  35.14 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  35.14 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2426  LrgA  33.33 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  33.04 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  34.86 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  26.21 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  35.45 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  37.17 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  33.62 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  28.04 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0854  hypothetical protein  29.47 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  39.47 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  36.84 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  34.48 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  31.86 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5344  LrgA family protein  38.39 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  27.43 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  39.29 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  42.47 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  36.56 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  29.21 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  27.78 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  28.32 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  26.09 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  37.14 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  43.04 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  25.56 
 
 		 138 aa  43.5  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  34 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  39.29 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  33.78 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  38.6 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  30.97 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  37.61 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  38.46 
 
 		 124 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  30.43 
 
 		 125 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  30.77 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  29.46 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0706  LrgA family protein  27.18 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156699  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1483  putative effector of murein hydrolase LrgA  29.21 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000434709  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  35.23 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  27.78 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  27.78 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  27.78 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  27.78 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  27.78 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  27.27 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  27.27 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  31.54 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  29.2 
 
 		 124 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  33.91 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  27.27 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  27.17 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  27.17 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  27.17 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  27.17 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  27.17 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  27.17 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  25 
 
 		 132 aa  40  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  27.17 
 
 		 132 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  27.17 
 
 		 132 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>