108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02118 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  239  7.999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003697  antiholin-like protein LrgA  90.32 
 
 		 124 aa  218  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0854  hypothetical protein  58.26 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1681  inner membrane protein, LrgA family  53.77 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  40.18 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  43.27 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  43.27 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  43.27 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  43.27 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  43.27 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  39.47 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  43.27 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  43.27 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  43.27 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  43.27 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  38.94 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  41.35 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  43.69 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  38.6 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  38.6 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  38.6 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  38.05 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  38.05 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  44.83 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  44.83 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  44.83 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  44.83 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  44.83 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2764  LrgA family protein  43.69 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  36.63 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  29.13 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0073  LrgA family protein  40.24 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  31.63 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  31.63 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  31.63 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  31.63 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  31.63 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  31.63 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  31.63 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  31.63 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  30.61 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  30.61 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  30.61 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  29.7 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  36.56 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  29.9 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  28.57 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  33.77 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  31.46 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  31.46 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  33.67 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3525  holin-like protein  30.3 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  25.44 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  30 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  32.14 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  27.27 
 
 		 248 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  31.08 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  30 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0100  LrgA family protein  40.62 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0090  LrgA family protein  40.62 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  28 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  28.24 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  28 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  28 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2117  LrgA family protein  25 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00374978  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  31.25 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  26 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4925  holin-like protein  24.58 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.365696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  34.85 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  30.16 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2564  LrgA family protein  26.73 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2617  LrgA family protein  26.73 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  34.85 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  36.63 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2976  LrgA family protein  36.36 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.952939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2404  LrgA family protein  36.36 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4960  holin-like protein  22.88 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4812  holin-like protein  22.88 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4822  holin-like protein  22.88 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  27.47 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5741  LrgA family protein  22.88 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178867  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  32.67 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  24.11 
 
 		 162 aa  42.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2210  LrgA family protein  29 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.522821  normal  0.122076 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  34.48 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5282  holin-like protein  22.88 
 
 		 124 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000144803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5247  holin-like protein  22.88 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.697113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5705  holin-like protein  22.88 
 
 		 124 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0190593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5218  holin-like protein  22.88 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  29.29 
 
 		 113 aa  42.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5236  holin-like protein  22.88 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  27.12 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1483  putative effector of murein hydrolase LrgA  32.43 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000434709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7209  hypothetical protein  30.69 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  27.12 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  37.33 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  37.25 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0421  LrgA family protein  28.21 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.712638  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  27.08 
 
 		 117 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0184  hypothetical protein  31.75 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>