99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0421 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0421  LrgA family protein  100 
 
 
135 aa  261  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.712638  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  88.81 
 
 
139 aa  236  6.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  88.81 
 
 
139 aa  236  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3795  LrgA family protein  62.96 
 
 
135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  62.99 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7209  hypothetical protein  60.45 
 
 
139 aa  141  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0273  hypothetical protein  54.92 
 
 
129 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0268  hypothetical protein  54.1 
 
 
129 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  43.36 
 
 
128 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  43.36 
 
 
128 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  42.34 
 
 
128 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  41.35 
 
 
163 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0062  LrgA family protein  45.92 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0043  LrgA family protein  45.92 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0027  LrgA  45.92 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0244  LrgA family protein  42.2 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0046  LrgA family protein  43.55 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  46.24 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0044  LrgA family protein  44.9 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8296  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3227  LrgA  46.99 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  37.17 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19680  hypothetical protein  44.35 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54207  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1694  hypothetical protein  42.61 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0024  LrgA family protein  44.34 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0026  LrgA family protein  43.4 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3500  LrgA family protein  43.4 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0025  LrgA family protein  43.4 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0899  LrgA  41 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0237  LrgA family protein  43.4 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2768  LrgA family protein  43.4 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2681  LrgA family protein  43.4 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  37.9 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1871  LrgA family protein  43.4 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0272  LrgA family protein  42.73 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0320417  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  34.62 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4665  LrgA family protein  41.44 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.338361  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4530  LrgA family protein  41.44 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.896487  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4524  LrgA family protein  41.44 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4615  LrgA family protein  41.44 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.299586 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4617  LrgA family protein  41.44 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  34.62 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  34.62 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  34.62 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0090  LrgA family protein  44.58 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  34.62 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  34.62 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  34.62 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  34.62 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0100  LrgA family protein  44.58 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  34.62 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  33.65 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  33.65 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0829  LrgA family protein  36.26 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1687  hypothetical protein  38.71 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172146  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1606  LrgA  37.04 
 
 
186 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0083  LrgA  43.37 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177337  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3025  LrgA family protein  33.33 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  37.29 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  30.91 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4428  LrgA family protein  38.4 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.409385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1047  hypothetical protein  29.73 
 
 
128 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0885  LrgA family protein  31.46 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000433815  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0922  LrgA family protein  31.46 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310437  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3050  LrgA family protein  31.46 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119689  normal  0.0263199 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0902  LrgA family protein  32.63 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000398223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0989  LrgA family protein  28.83 
 
 
144 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3389  LrgA family protein  28.83 
 
 
144 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  33.33 
 
 
116 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0975  LrgA family protein  28.83 
 
 
144 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0954  LrgA family protein  28.83 
 
 
144 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  34.83 
 
 
124 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  32.41 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  34.91 
 
 
116 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  36.94 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  35.48 
 
 
123 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  32.76 
 
 
248 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0893  LrgA family protein  28.28 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  30.85 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  29.41 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  34.65 
 
 
119 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  35.9 
 
 
125 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  32.71 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2927  holin-like protein  36.36 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00321045  normal  0.271061 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0887  LrgA family protein  38.14 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  28.83 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  29.82 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  32.99 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  31.58 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0292  LrgA family protein  36.08 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  31.37 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  29.52 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  35.56 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  28.21 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3004  LrgA family protein  34.26 
 
 
130 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  29 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2564  LrgA family protein  35.9 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2617  LrgA family protein  35.9 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  30.3 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  32.38 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>