77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1606 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1606  LrgA  100 
 
 		 186 aa  363  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0046  LrgA family protein  47.55 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  46.51 
 
 		 158 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  44.72 
 
 		 163 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0044  LrgA family protein  45.86 
 
 		 158 aa  95.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0027  LrgA  45.74 
 
 		 157 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0062  LrgA family protein  45.74 
 
 		 157 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0043  LrgA family protein  45.74 
 
 		 157 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3227  LrgA  48.62 
 
 		 158 aa  91.3  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0244  LrgA family protein  40.5 
 
 		 157 aa  87.8  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0025  LrgA family protein  47.9 
 
 		 156 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0237  LrgA family protein  47.9 
 
 		 156 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3500  LrgA family protein  47.9 
 
 		 156 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2768  LrgA family protein  48.28 
 
 		 132 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2681  LrgA family protein  48.28 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1871  LrgA family protein  48.28 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0026  LrgA family protein  47.06 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  35.16 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0024  LrgA family protein  48.21 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  34.01 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  33.61 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  38.3 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  38.2 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1687  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172146  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3795  LrgA family protein  37.19 
 
 		 135 aa  67  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0421  LrgA family protein  36.28 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.712638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7209  hypothetical protein  36.09 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  40 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1047  hypothetical protein  42.31 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0885  LrgA family protein  42.31 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000433815  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3050  LrgA family protein  42.31 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119689  normal  0.0263199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0922  LrgA family protein  42.31 
 
 		 144 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3025  LrgA family protein  42.11 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3389  LrgA family protein  41.03 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0975  LrgA family protein  41.03 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0989  LrgA family protein  41.03 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0954  LrgA family protein  41.03 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0902  LrgA family protein  39.73 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398223 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19680  hypothetical protein  36.51 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4428  LrgA family protein  39.25 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.409385 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  40 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  36.67 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1694  hypothetical protein  36.62 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0899  LrgA  36.36 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  37.97 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  37.97 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  37.97 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  37.97 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  37.97 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  37.97 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  37.97 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  37.97 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  37.97 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  37.97 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0829  LrgA family protein  42.65 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  36.71 
 
 		 121 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2927  holin-like protein  37.84 
 
 		 143 aa  52.4  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00321045  normal  0.271061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0083  LrgA  41.94 
 
 		 136 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177337  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0090  LrgA family protein  41.03 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0893  LrgA family protein  39.24 
 
 		 161 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0100  LrgA family protein  41.03 
 
 		 138 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  24.6 
 
 		 248 aa  46.2  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0272  LrgA family protein  34.15 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4530  LrgA family protein  28.85 
 
 		 171 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.896487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  26.79 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  29.9 
 
 		 129 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4665  LrgA family protein  28.21 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.338361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  25 
 
 		 125 aa  42  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  24.11 
 
 		 135 aa  42  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  41.51 
 
 		 113 aa  41.6  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  33.75 
 
 		 121 aa  42  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2739  LrgA family protein  45.1 
 
 		 117 aa  41.6  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  25 
 
 		 125 aa  41.6  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6538  LrgA family protein  32.53 
 
 		 134 aa  41.2  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139896 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  29.41 
 
 		 136 aa  40.8  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>