20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6538 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6538  LrgA family protein  100 
 
 		 134 aa  253  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0244  LrgA family protein  35.54 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  34.83 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  30.68 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  30.68 
 
 		 125 aa  44.3  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  33.71 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  33.71 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  33.71 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  33.71 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  33.71 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  33.71 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  33.71 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  33.71 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  33.71 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2564  LrgA family protein  27.03 
 
 		 131 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2617  LrgA family protein  27.03 
 
 		 131 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  32.58 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1606  LrgA  35.19 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  27.88 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  34.83 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>