83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0244 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0244  LrgA family protein  100 
 
 		 157 aa  310  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  42.74 
 
 		 139 aa  86.3  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  42.74 
 
 		 139 aa  86.3  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7209  hypothetical protein  47.66 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  41.88 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  41.32 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  43.52 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1606  LrgA  40.5 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1687  hypothetical protein  42.64 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172146  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4428  LrgA family protein  43.59 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.409385 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  35.76 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  37.04 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  48.76 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0044  LrgA family protein  48.76 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0046  LrgA family protein  45 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0421  LrgA family protein  42.2 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.712638  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0043  LrgA family protein  45.83 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0062  LrgA family protein  45.83 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3795  LrgA family protein  36.57 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0027  LrgA  45.83 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0899  LrgA  45.28 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2681  LrgA family protein  41.59 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1871  LrgA family protein  41.59 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0272  LrgA family protein  43.24 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3227  LrgA  45.37 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0237  LrgA family protein  42.99 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3500  LrgA family protein  42.99 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0025  LrgA family protein  42.99 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2768  LrgA family protein  41.59 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0024  LrgA family protein  43.27 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0026  LrgA family protein  42.06 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  29.46 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0893  LrgA family protein  36.36 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  36.79 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0902  LrgA family protein  29.01 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398223 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  36.79 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  36.79 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0090  LrgA family protein  42.39 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  35.85 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0100  LrgA family protein  42.39 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  35.85 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  35.85 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  35.85 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  36.08 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  35.05 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1047  hypothetical protein  37.04 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  35.85 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0922  LrgA family protein  34.71 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  35.85 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0885  LrgA family protein  37.04 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000433815  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3050  LrgA family protein  37.04 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119689  normal  0.0263199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3025  LrgA family protein  34.96 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0954  LrgA family protein  37.97 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0975  LrgA family protein  37.97 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0989  LrgA family protein  37.97 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3389  LrgA family protein  37.97 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4665  LrgA family protein  39.64 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.338361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4530  LrgA family protein  39.64 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.896487  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4617  LrgA family protein  39.64 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4615  LrgA family protein  39.64 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.299586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4524  LrgA family protein  39.64 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0083  LrgA  43.42 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177337  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2927  holin-like protein  39.71 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00321045  normal  0.271061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19680  hypothetical protein  46.67 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1694  hypothetical protein  45.33 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  35.24 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0273  hypothetical protein  40.51 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0268  hypothetical protein  40.51 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0829  LrgA family protein  33.33 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  31.9 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  31.03 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6538  LrgA family protein  35.54 
 
 		 134 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139896 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  26.37 
 
 		 118 aa  48.5  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  29.91 
 
 		 124 aa  48.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  34.62 
 
 		 138 aa  47.4  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  25.93 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  24.03 
 
 		 248 aa  44.3  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3525  holin-like protein  29.81 
 
 		 118 aa  41.2  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  27.27 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  25.38 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  27.37 
 
 		 125 aa  40.8  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  27.37 
 
 		 125 aa  40.4  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>