118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3525 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3525  holin-like protein  100 
 
 
118 aa  221  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  90.68 
 
 
118 aa  202  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  90.68 
 
 
118 aa  202  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  90.68 
 
 
118 aa  202  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  88.98 
 
 
118 aa  201  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5282  holin-like protein  48.31 
 
 
124 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000144803  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5705  holin-like protein  48.31 
 
 
124 aa  110  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0190593  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5741  LrgA family protein  48.31 
 
 
125 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4960  holin-like protein  48.31 
 
 
122 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4812  holin-like protein  48.31 
 
 
122 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4822  holin-like protein  48.31 
 
 
122 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5247  holin-like protein  48.31 
 
 
122 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.697113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5218  holin-like protein  48.31 
 
 
122 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5236  holin-like protein  47.46 
 
 
122 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4925  holin-like protein  48.31 
 
 
122 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.365696  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3510  murein hydrolase exporter  83.58 
 
 
84 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3677  holin-like protein  48.31 
 
 
122 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3498  murein hydrolase exporter  82.09 
 
 
84 aa  104  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000157702  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  33 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  35.04 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  40 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  33.96 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  33.33 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  33.33 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  33.33 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  33.33 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  33.33 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  33.33 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  33.33 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  33.33 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  33.33 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  34.75 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  32.71 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  38.32 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  34.91 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  34.91 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  34.91 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  34.91 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  34.91 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  34.91 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  34.91 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  34.91 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  39.33 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  33.62 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  34.91 
 
 
116 aa  63.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  34.91 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  29.91 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  29.91 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2564  LrgA family protein  34.34 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2617  LrgA family protein  34.34 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2117  LrgA family protein  30.56 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00374978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4428  LrgA family protein  39 
 
 
140 aa  60.1  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.409385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  35.71 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  35.35 
 
 
121 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  36.36 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  37.33 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  37.33 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  37.33 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  37.33 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  37.33 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  30.84 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  30.84 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  30.84 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  37.62 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  37.62 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  40 
 
 
128 aa  52  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0854  hypothetical protein  27.97 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  31.68 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  33.33 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  30.61 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2764  LrgA family protein  37.76 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  30.3 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  33.65 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  33.77 
 
 
130 aa  48.9  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  32.38 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  29 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0272  LrgA family protein  29.46 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0320417  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4617  LrgA family protein  33.73 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4615  LrgA family protein  33.73 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.299586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4524  LrgA family protein  33.73 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3050  LrgA family protein  34.62 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119689  normal  0.0263199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0899  LrgA  30.1 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4530  LrgA family protein  33.02 
 
 
171 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.896487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4665  LrgA family protein  33.02 
 
 
171 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.338361  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0885  LrgA family protein  33.65 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000433815  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0046  LrgA family protein  33.33 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  28 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003697  antiholin-like protein LrgA  29.29 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  25 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  31 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0922  LrgA family protein  33.65 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310437  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  31.25 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  28.44 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  24.77 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  28.3 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0090  LrgA family protein  31.4 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0044  LrgA family protein  31.58 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8296  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19680  hypothetical protein  32.32 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54207  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  23.64 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0062  LrgA family protein  31.25 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>