107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00870 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2908  LrgA family protein  64.35 
 
 		 167 aa  132  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  31.97 
 
 		 153 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  41.11 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  41.11 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  41.11 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  41.11 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  41.11 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  41.11 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  41.11 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  41.11 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  41.11 
 
 		 132 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  35.51 
 
 		 125 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  35.51 
 
 		 125 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  41.46 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  38.89 
 
 		 132 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  35 
 
 		 138 aa  67  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  31.78 
 
 		 148 aa  64.7  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  47.69 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  47.69 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  47.69 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  47.69 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  47.69 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  34.29 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  42.68 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  33.02 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  35.56 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  35.56 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  35.56 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  35.16 
 
 		 136 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  32.06 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0899  LrgA  33.65 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  41.79 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  35.56 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  32.31 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  31.53 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  32.35 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  31.91 
 
 		 121 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  31.07 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  35.71 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1950  LrgA family protein  33.94 
 
 		 119 aa  54.7  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000107186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0624  LrgA  37.66 
 
 		 128 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.938941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  32.98 
 
 		 117 aa  54.3  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0247  murein hydrolase regulator LrgA  24 
 
 		 145 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0253  murein hydrolase regulator LrgA  24 
 
 		 145 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  36.9 
 
 		 124 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  40 
 
 		 129 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2764  LrgA family protein  34.48 
 
 		 138 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  32.62 
 
 		 139 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  32.62 
 
 		 139 aa  53.1  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  33.7 
 
 		 118 aa  52.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2117  LrgA family protein  35.83 
 
 		 130 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00374978  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2026  murein hydrolase regulator LrgA  32.47 
 
 		 152 aa  52.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0706  LrgA family protein  38.57 
 
 		 131 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156699  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1483  putative effector of murein hydrolase LrgA  37.5 
 
 		 124 aa  50.1  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000434709  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  34.52 
 
 		 163 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1681  inner membrane protein, LrgA family  35.21 
 
 		 110 aa  49.7  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  32.35 
 
 		 123 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3004  LrgA family protein  38.1 
 
 		 130 aa  49.3  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149466 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1346  LrgA family protein  37.5 
 
 		 145 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.749748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  30.61 
 
 		 121 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  28.97 
 
 		 116 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  29.25 
 
 		 128 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  32.41 
 
 		 134 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  26.36 
 
 		 128 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  29 
 
 		 118 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3227  LrgA  31.51 
 
 		 158 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  29 
 
 		 118 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003697  antiholin-like protein LrgA  28.57 
 
 		 124 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  27.27 
 
 		 124 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  30.61 
 
 		 121 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  29 
 
 		 118 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  33.87 
 
 		 130 aa  46.2  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  29.67 
 
 		 123 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  29.25 
 
 		 122 aa  45.8  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1099  hypothetical protein  39.29 
 
 		 132 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  27.72 
 
 		 158 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0044  LrgA family protein  27.72 
 
 		 158 aa  45.4  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3795  LrgA family protein  31.07 
 
 		 135 aa  45.4  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  32.5 
 
 		 121 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  32.5 
 
 		 121 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0027  LrgA  30.14 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0043  LrgA family protein  30.14 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0046  LrgA family protein  28.17 
 
 		 148 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0062  LrgA family protein  31.51 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0665  LrgA family protein  34.21 
 
 		 123 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  29.59 
 
 		 121 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  29.59 
 
 		 121 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  29.59 
 
 		 121 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  27.08 
 
 		 136 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0421  LrgA family protein  33.8 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.712638  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  27.84 
 
 		 119 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  30.56 
 
 		 124 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3929  LrgA family protein  28.3 
 
 		 128 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.319977 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  29.59 
 
 		 121 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  29.59 
 
 		 121 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  29.59 
 
 		 121 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  31.25 
 
 		 121 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0100  LrgA family protein  38.46 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0073  LrgA family protein  36.07 
 
 		 114 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>