192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_3730 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  100 
 
 
121 aa  236  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  100 
 
 
121 aa  236  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  99.17 
 
 
121 aa  236  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  99.17 
 
 
121 aa  236  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  99.17 
 
 
121 aa  236  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  99.17 
 
 
121 aa  236  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  98.35 
 
 
121 aa  234  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  96.69 
 
 
121 aa  233  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  96.69 
 
 
121 aa  233  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  97.52 
 
 
121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  96.69 
 
 
121 aa  231  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  38.26 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0885  LrgA family protein  37.5 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000433815  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  38.83 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3050  LrgA family protein  37.5 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119689  normal  0.0263199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0922  LrgA family protein  37.5 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310437  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  35.04 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  35.04 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  35.04 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1047  hypothetical protein  35.51 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0975  LrgA family protein  38.46 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3389  LrgA family protein  38.46 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0989  LrgA family protein  38.46 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0954  LrgA family protein  38.46 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19680  hypothetical protein  36.84 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54207  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1694  hypothetical protein  38.32 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0893  LrgA family protein  42.2 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  34.51 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3025  LrgA family protein  37.5 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2117  LrgA family protein  36.13 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00374978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  38.78 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  33.33 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  38.46 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0899  LrgA  39.13 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3525  holin-like protein  33.33 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  34.19 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  34.26 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0090  LrgA family protein  37.65 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  32.98 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0829  LrgA family protein  35.79 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0100  LrgA family protein  37.65 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  33.65 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0244  LrgA family protein  35.85 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0902  LrgA family protein  36.54 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000398223 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  33.65 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0046  LrgA family protein  35.44 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0062  LrgA family protein  35.44 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  30.36 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0044  LrgA family protein  34.18 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8296  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3227  LrgA  35.44 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0027  LrgA  34.18 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  34.18 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0043  LrgA family protein  34.18 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  38.37 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  30.7 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  35.35 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  30.56 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2564  LrgA family protein  39.81 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2617  LrgA family protein  39.81 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  35.42 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7209  hypothetical protein  31.78 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  36.46 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  30.77 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5236  holin-like protein  33.33 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4960  holin-like protein  32.48 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4812  holin-like protein  32.48 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4822  holin-like protein  32.48 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5247  holin-like protein  32.48 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.697113  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  29.31 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5741  LrgA family protein  32.48 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0083  LrgA  38.82 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  35.09 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  35.09 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  31.13 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  29.13 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5218  holin-like protein  32.48 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5282  holin-like protein  32.48 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000144803  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4925  holin-like protein  33.33 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.365696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5705  holin-like protein  32.48 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0190593  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  30.56 
 
 
128 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  29.31 
 
 
135 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  30.93 
 
 
129 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  35.71 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3795  LrgA family protein  29.91 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  29.31 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  42.42 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0421  LrgA family protein  34.62 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.712638  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  30 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  31.13 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  30.43 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  30.43 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  31.9 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  29.57 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  29.57 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  30.36 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  29.57 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  33.02 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  29.57 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  29.57 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  29.57 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>