101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4336 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  100 
 
 		 162 aa  315  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  64.52 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  64.52 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0421  LrgA family protein  62.99 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.712638  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3795  LrgA family protein  57.03 
 
 		 135 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7209  hypothetical protein  57.6 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  43.75 
 
 		 128 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  42.98 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  42.34 
 
 		 128 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  45.13 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0273  hypothetical protein  47.97 
 
 		 129 aa  90.5  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0268  hypothetical protein  47.97 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0899  LrgA  46.08 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  44.86 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0062  LrgA family protein  45.74 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0027  LrgA  45.74 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0043  LrgA family protein  45.74 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0244  LrgA family protein  35.76 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0044  LrgA family protein  42.99 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19680  hypothetical protein  46.49 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3227  LrgA  48.19 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1694  hypothetical protein  45.61 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1871  LrgA family protein  47.17 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2681  LrgA family protein  47.17 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0046  LrgA family protein  44.57 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0024  LrgA family protein  47.17 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  35.25 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4617  LrgA family protein  45.69 
 
 		 136 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4615  LrgA family protein  45.69 
 
 		 136 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.299586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4524  LrgA family protein  45.69 
 
 		 136 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4530  LrgA family protein  45.3 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.896487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4665  LrgA family protein  45.3 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.338361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0237  LrgA family protein  46.23 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3500  LrgA family protein  46.23 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0026  LrgA family protein  46.23 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0025  LrgA family protein  46.23 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2768  LrgA family protein  46.23 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0272  LrgA family protein  45.45 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1687  hypothetical protein  39.2 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172146  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  39.04 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4428  LrgA family protein  42.06 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.409385 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  30.77 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  30.77 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  30.77 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  30.77 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  30.77 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  30.77 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  30.77 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  29.81 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  30.77 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3050  LrgA family protein  38.89 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119689  normal  0.0263199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0922  LrgA family protein  38.89 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0885  LrgA family protein  38.89 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000433815  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  30.77 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  30.77 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1047  hypothetical protein  36.96 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  35.71 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  31.91 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1606  LrgA  43.75 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  36.27 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3025  LrgA family protein  37.78 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0090  LrgA family protein  43 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0829  LrgA family protein  36.84 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0902  LrgA family protein  31.25 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3389  LrgA family protein  37.78 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0954  LrgA family protein  37.78 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0989  LrgA family protein  37.78 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  29.81 
 
 		 121 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0975  LrgA family protein  37.78 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0100  LrgA family protein  41.9 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0083  LrgA  41.51 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  34.82 
 
 		 116 aa  50.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0893  LrgA family protein  30.77 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2117  LrgA family protein  31.63 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00374978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  26.13 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2927  holin-like protein  34.23 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00321045  normal  0.271061 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  28.87 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  33.01 
 
 		 128 aa  47.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  25.6 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2564  LrgA family protein  35.71 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2617  LrgA family protein  35.71 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  31.18 
 
 		 116 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  31.78 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  27.43 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  32.77 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  31.36 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  38.89 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2210  LrgA family protein  32 
 
 		 125 aa  45.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.522821  normal  0.122076 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  35.05 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0073  LrgA family protein  30 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  33.78 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  32 
 
 		 117 aa  44.3  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  24.11 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  28.32 
 
 		 125 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  30.25 
 
 		 123 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  31.4 
 
 		 121 aa  42  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  30.48 
 
 		 125 aa  41.6  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  25.74 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1950  LrgA family protein  21.9 
 
 		 119 aa  41.2  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000107186  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  40 
 
 		 128 aa  40.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>