153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1269 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  100 
 
 
121 aa  229  9e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  61.34 
 
 
119 aa  140  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  54.31 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  54.46 
 
 
125 aa  110  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  51.35 
 
 
122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  49.12 
 
 
130 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  50.42 
 
 
126 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  48.25 
 
 
117 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  53.57 
 
 
116 aa  100  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  49.11 
 
 
125 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  45.76 
 
 
121 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  45.9 
 
 
129 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  45.38 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  49.11 
 
 
113 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  47.58 
 
 
124 aa  90.9  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  43.36 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  45.45 
 
 
119 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2426  LrgA  47.58 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  47.97 
 
 
128 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  47.97 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  47.37 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  43.52 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  38.6 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  39.39 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  47.58 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  48.25 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  49.17 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  35.65 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  50 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  50 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  46.49 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5344  LrgA family protein  45.53 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6616  LrgA family protein  49.04 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.112454 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7637  LrgA  49.04 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3929  LrgA family protein  46.34 
 
 
128 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.319977 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3577  putative integral membrane protein  46.36 
 
 
125 aa  66.6  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0155  putative LrgA family protein  51.92 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  44.86 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3734  LrgA family protein  49.58 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  41.44 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  32.11 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  32.11 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0493  LrgA  44.35 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1160  LrgA family protein  37.84 
 
 
116 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  31 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  30.33 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  33.03 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  30.33 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  30.33 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3004  LrgA family protein  40.62 
 
 
130 aa  61.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149466 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0887  LrgA family protein  45.45 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  32.73 
 
 
125 aa  60.8  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2739  LrgA family protein  45.22 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1095  hypothetical protein  36.44 
 
 
120 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00291495  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  32.73 
 
 
125 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  33.06 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  28.69 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0332  LrgA  44.55 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2210  LrgA family protein  43.27 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.522821  normal  0.122076 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  29.31 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0292  LrgA family protein  45.05 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  37.23 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  32.71 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  31.13 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  31.13 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  30.19 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  30.19 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  30.19 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  30.19 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  30.19 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2976  LrgA family protein  40.79 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.952939  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  30.19 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0665  LrgA family protein  50.98 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810198  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3333  hypothetical protein  46.67 
 
 
117 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  30.19 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4059  LrgA family protein  46.67 
 
 
117 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  32.71 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  30.19 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2404  LrgA family protein  40.79 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  29.25 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  33.64 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  33.64 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  33.64 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  33.64 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  33.64 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  35.62 
 
 
134 aa  55.1  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  33.64 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  33.64 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  33.64 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0545  LrgA family protein  45.45 
 
 
127 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11920  hypothetical protein  36.13 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00345177  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  27.68 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  33.94 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  32.71 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  31.93 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  31.93 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  31.93 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0447  LrgA  29.81 
 
 
121 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  31.93 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  31.93 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>