184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0425 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  100 
 
 
116 aa  214  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  54.46 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  50.43 
 
 
128 aa  104  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  50.89 
 
 
113 aa  103  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  46.36 
 
 
119 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  52.73 
 
 
119 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  53.57 
 
 
121 aa  100  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  52.68 
 
 
125 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  51.96 
 
 
124 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  53.21 
 
 
126 aa  94.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  46.9 
 
 
130 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  48.72 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  50 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  45.54 
 
 
122 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  44.35 
 
 
122 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  43.48 
 
 
121 aa  87  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  48.25 
 
 
123 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  45.16 
 
 
133 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  50 
 
 
123 aa  83.6  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0887  LrgA family protein  57.73 
 
 
123 aa  83.6  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  47.5 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  43.97 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3577  putative integral membrane protein  45.45 
 
 
125 aa  80.1  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5344  LrgA family protein  46.09 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  37.5 
 
 
115 aa  77  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  40.37 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  36.75 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  45.87 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  42.11 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  42.11 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  47.37 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1095  hypothetical protein  44.92 
 
 
120 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00291495  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  39.39 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  45.61 
 
 
119 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  39 
 
 
116 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  46.49 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3004  LrgA family protein  53.15 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149466 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  41.03 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1160  LrgA family protein  37.39 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  43.96 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7637  LrgA  48.08 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  49.5 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  49.5 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  36.94 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  36.52 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  35.85 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3734  LrgA family protein  50.45 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  36.79 
 
 
118 aa  67  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  36.79 
 
 
118 aa  67  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  36.79 
 
 
118 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0292  LrgA family protein  48.7 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0735  LrgA family protein  41.88 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233913  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6616  LrgA family protein  48.51 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.112454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  36.75 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3929  LrgA family protein  42 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.319977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  42.37 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  34.55 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11920  hypothetical protein  46.22 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00345177  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  34.55 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  36.61 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0665  LrgA family protein  46.59 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3525  holin-like protein  34.91 
 
 
118 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  31.13 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  31.13 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  31.13 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  30.19 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  30.19 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  30.19 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  33.94 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  30.19 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  30.19 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  30.19 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0155  putative LrgA family protein  47.87 
 
 
118 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0636  LrgA  38.6 
 
 
120 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2739  LrgA family protein  43.24 
 
 
117 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  30.19 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  30.19 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  40.57 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  34.45 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0605  LrgA  43.59 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  33.33 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0332  LrgA  40.91 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4925  holin-like protein  33.64 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.365696  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  33.04 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  33.04 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5236  holin-like protein  32.43 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5705  holin-like protein  32.43 
 
 
124 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0190593  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5282  holin-like protein  32.43 
 
 
124 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000144803  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  33.04 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  33.04 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  33.04 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  33.04 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4960  holin-like protein  32.43 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5218  holin-like protein  32.43 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4812  holin-like protein  32.43 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4822  holin-like protein  32.43 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5741  LrgA family protein  32.43 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  38.89 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5247  holin-like protein  32.43 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.697113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  32.17 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>