96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1681 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1681  inner membrane protein, LrgA family  100 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  53.77 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003697  antiholin-like protein LrgA  53.77 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0854  hypothetical protein  51.4 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  40.2 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  40.57 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  44.21 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  44.21 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  44.21 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  44.21 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  44.21 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  44.21 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  44.21 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  44.21 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  44.21 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  45.26 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  35.24 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  45.45 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  45.45 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  45.45 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  45.45 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  45.45 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  35.24 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  35.24 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  43.16 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2764  LrgA family protein  44.33 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  34.91 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  34.91 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  34.91 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  34.34 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  29.59 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  30.34 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  41.54 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  25.49 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  29.55 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  29.17 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  30.61 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  40 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  33.66 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  33.66 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  29.59 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  33.33 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  35.21 
 
 		 248 aa  50.1  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  26.67 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  26.67 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  26.67 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  26.67 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  26.67 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  26.67 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  26.67 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  33.33 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  28.28 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  26.67 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0899  LrgA  29.41 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  34.72 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  25.71 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  32.99 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  24.21 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  25.71 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  27.5 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  27.27 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  28.18 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  29.46 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  28.97 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  27.55 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  27.52 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  32.04 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0090  LrgA family protein  29.07 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0100  LrgA family protein  29.07 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  30.23 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  29.41 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0272  LrgA family protein  26.79 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1483  putative effector of murein hydrolase LrgA  33.33 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000434709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  32.04 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  25.84 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  32.89 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3525  holin-like protein  33.33 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  32.88 
 
 		 124 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  30.53 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  32.86 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1325  LrgA family protein  26.53 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4925  holin-like protein  26.74 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.365696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0244  LrgA family protein  22.68 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4812  holin-like protein  26 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4822  holin-like protein  26 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4960  holin-like protein  26 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5218  holin-like protein  26 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5247  holin-like protein  26 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.697113  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  27.27 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5705  holin-like protein  26 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0190593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5282  holin-like protein  26 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000144803  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5741  LrgA family protein  26 
 
 		 125 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5236  holin-like protein  26 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2117  LrgA family protein  32.79 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00374978  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1230  LrgA family protein  22.73 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>