148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4925 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4925  holin-like protein  100 
 
 
122 aa  240  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.365696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5741  LrgA family protein  95.08 
 
 
125 aa  208  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5282  holin-like protein  95.08 
 
 
124 aa  208  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000144803  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5218  holin-like protein  95.08 
 
 
122 aa  207  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4960  holin-like protein  95.08 
 
 
122 aa  207  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4812  holin-like protein  95.08 
 
 
122 aa  207  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4822  holin-like protein  95.08 
 
 
122 aa  207  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5247  holin-like protein  95.08 
 
 
122 aa  207  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.697113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5705  holin-like protein  95.08 
 
 
124 aa  208  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0190593  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5236  holin-like protein  94.26 
 
 
122 aa  207  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3677  holin-like protein  87.7 
 
 
122 aa  191  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  51.69 
 
 
118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3525  holin-like protein  48.31 
 
 
118 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  48.31 
 
 
118 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  48.31 
 
 
118 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  48.31 
 
 
118 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  35.64 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  33.33 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  33.33 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  33.33 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  33.33 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  31.58 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  32.48 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  32.48 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  32.48 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  32.48 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  32.48 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  32.48 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  32.48 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  31.78 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  33.65 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3510  murein hydrolase exporter  46.27 
 
 
84 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3498  murein hydrolase exporter  46.27 
 
 
84 aa  67  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000157702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  31.78 
 
 
135 aa  66.6  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  31.78 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  32.76 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  32.76 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  28.45 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  30.77 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2117  LrgA family protein  27.59 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00374978  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  33.64 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  30.1 
 
 
163 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4428  LrgA family protein  27.5 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.409385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  29.09 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  29.09 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  31.58 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  29.09 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  29.09 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  29.09 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  29.09 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  29.09 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  29.09 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  30.17 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  28.18 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0046  LrgA family protein  36.46 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  33.33 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  28.85 
 
 
163 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19680  hypothetical protein  28.69 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54207  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  30 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1687  hypothetical protein  35.25 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  27.43 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0062  LrgA family protein  34.38 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0044  LrgA family protein  32.32 
 
 
158 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8296  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0027  LrgA  33.33 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  25.93 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0043  LrgA family protein  33.33 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  26.36 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1694  hypothetical protein  27.87 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  27.36 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  27.36 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  27.36 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  26.72 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  39.71 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  39.71 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  39.71 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  39.71 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  39.71 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  31.43 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0899  LrgA  30.84 
 
 
128 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  28.85 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0272  LrgA family protein  32.08 
 
 
136 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0320417  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5572  murein hydrolase regulator LrgA  27.52 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5294  murein hydrolase regulator LrgA  27.52 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5121  murein hydrolase regulator LrgA  27.52 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5136  murein hydrolase regulator LrgA  27.52 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5690  murein hydrolase regulator LrgA  27.52 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5385  murein hydrolase regulator LrgA  27.52 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.655957 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5535  murein hydrolase regulator LrgA  27.52 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5564  murein hydrolase regulator LrgA  27.52 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2564  LrgA family protein  26.47 
 
 
131 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2617  LrgA family protein  26.47 
 
 
131 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  30.53 
 
 
124 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  24.58 
 
 
124 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  26.09 
 
 
116 aa  51.2  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3795  LrgA family protein  29.9 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  31.43 
 
 
128 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5620  murein hydrolase regulator LrgA  26.61 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  31.19 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  25.22 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  27.27 
 
 
248 aa  49.7  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>